More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0009 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  672    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1566 aa  3144    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  33.74 
 
 		 1478 aa  684    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1339 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  41.43 
 
 		 1281 aa  670    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  34.11 
 
 		 1331 aa  691    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  33.35 
 
 		 1391 aa  670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  34.6 
 
 		 1297 aa  690    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  34.51 
 
 		 1375 aa  787    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.82 
 
 		 1306 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  33.9 
 
 		 1466 aa  705    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.43 
 
 		 1300 aa  670    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.71 
 
 		 1306 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  32.65 
 
 		 1341 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  32.49 
 
 		 1330 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.71 
 
 		 1306 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  35.41 
 
 		 1307 aa  770    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.76 
 
 		 1295 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  31.98 
 
 		 1423 aa  684    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  34.04 
 
 		 1336 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  36.56 
 
 		 1316 aa  797    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.71 
 
 		 1300 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  34.76 
 
 		 1318 aa  748    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  34.62 
 
 		 1367 aa  698    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  34.35 
 
 		 1311 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  35.23 
 
 		 1289 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.76 
 
 		 1295 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  38.89 
 
 		 1624 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.11 
 
 		 1298 aa  786    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  35.34 
 
 		 1355 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1305 aa  729    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  33.42 
 
 		 1351 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  34.1 
 
 		 1298 aa  690    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.98 
 
 		 1328 aa  767    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.39 
 
 		 1339 aa  752    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  36.47 
 
 		 1325 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.07 
 
 		 1345 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  31.96 
 
 		 1421 aa  696    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  34.02 
 
 		 1306 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  34.72 
 
 		 1282 aa  753    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.96 
 
 		 1303 aa  733    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  34.64 
 
 		 1360 aa  714    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 		 1341 aa  783    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  672    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  41.66 
 
 		 1309 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  672    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.82 
 
 		 1306 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  32.63 
 
 		 1438 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.73 
 
 		 1300 aa  751    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.1 
 
 		 1312 aa  737    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.55 
 
 		 1300 aa  672    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  43.19 
 
 		 1282 aa  632  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  39.98 
 
 		 1295 aa  621  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  40.47 
 
 		 1560 aa  608  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  38.86 
 
 		 1441 aa  601  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  39.66 
 
 		 1435 aa  591  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  39.02 
 
 		 1349 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  31.94 
 
 		 1231 aa  576  1.0000000000000001e-162  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  49.67 
 
 		 1303 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  47.18 
 
 		 1310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  47.6 
 
 		 1298 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.7 
 
 		 1309 aa  555  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  48.29 
 
 		 1315 aa  555  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  46.89 
 
 		 1295 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.06 
 
 		 1295 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  46.86 
 
 		 1296 aa  553  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  47.45 
 
 		 1295 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  45.6 
 
 		 1289 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1361 aa  549  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.5 
 
 		 1295 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.15 
 
 		 1295 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.1 
 
 		 1295 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  46.72 
 
 		 1291 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  46.44 
 
 		 1291 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  47.05 
 
 		 1293 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  46.44 
 
 		 1293 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  46.28 
 
 		 1293 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  46.44 
 
 		 1293 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  46.72 
 
 		 1293 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  46.6 
 
 		 1291 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  46.23 
 
 		 1293 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  47.05 
 
 		 1293 aa  536  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  46.72 
 
 		 1293 aa  536  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  34.8 
 
 		 1378 aa  536  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  47.62 
 
 		 1320 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  46.14 
 
 		 1291 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  46.95 
 
 		 1428 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  45.2 
 
 		 1291 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  45.44 
 
 		 1329 aa  515  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  46.07 
 
 		 1275 aa  512  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  47.39 
 
 		 1310 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  45.95 
 
 		 1324 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4670  ATP-dependent helicase HrpA  44.06 
 
 		 1333 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  46.1 
 
 		 1298 aa  482  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  45.95 
 
 		 1317 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  45.12 
 
 		 1411 aa  479  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  55.94 
 
 		 1318 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  50.52 
 
 		 1308 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>