More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0877 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  41.46 
 
 		 1295 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  43.69 
 
 		 1301 aa  928    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.45 
 
 		 1300 aa  1018    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  43.17 
 
 		 1301 aa  920    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  56.34 
 
 		 1298 aa  1431    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.55 
 
 		 1295 aa  1014    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42 
 
 		 1295 aa  975    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.25 
 
 		 1300 aa  1006    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  42.45 
 
 		 1281 aa  1019    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  42.45 
 
 		 1300 aa  1018    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  40.9 
 
 		 1374 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  72.45 
 
 		 1391 aa  1963    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  43.54 
 
 		 1301 aa  933    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  36.83 
 
 		 1478 aa  781    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  42.49 
 
 		 1294 aa  963    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  55.41 
 
 		 1331 aa  1395    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  55.98 
 
 		 1333 aa  1411    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2556  ATP-dependent helicase HrpA  77.13 
 
 		 1341 aa  2053    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0904088  hitchhiker  0.00638433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  40.21 
 
 		 1317 aa  851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  64.25 
 
 		 1411 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  42.8 
 
 		 1303 aa  957    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  56.02 
 
 		 1375 aa  1439    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1375 aa  1438    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  36.62 
 
 		 1438 aa  813    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  66 
 
 		 1353 aa  1779    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  37.79 
 
 		 1441 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.52 
 
 		 1300 aa  1019    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  57.2 
 
 		 1378 aa  1449    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  43.87 
 
 		 1339 aa  1014    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1300 aa  1014    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  56.56 
 
 		 1403 aa  1445    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  42.66 
 
 		 1303 aa  957    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.6 
 
 		 1300 aa  1018    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  34.96 
 
 		 1423 aa  776    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  43.65 
 
 		 1329 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  42.77 
 
 		 1324 aa  966    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  52.69 
 
 		 1323 aa  792    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  44.01 
 
 		 1290 aa  999    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  42.63 
 
 		 1326 aa  937    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  56.02 
 
 		 1375 aa  1437    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  46.83 
 
 		 1281 aa  1132    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  42.32 
 
 		 1303 aa  962    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  67.35 
 
 		 1351 aa  1790    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  43.51 
 
 		 1316 aa  1000    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  56.43 
 
 		 1402 aa  1449    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.37 
 
 		 1309 aa  1014    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  37.51 
 
 		 1342 aa  855    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  44.47 
 
 		 1329 aa  1104    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  70.99 
 
 		 1306 aa  1917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  55.87 
 
 		 1380 aa  1440    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  71.89 
 
 		 1341 aa  1925    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.52 
 
 		 1300 aa  1020    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  43.54 
 
 		 1301 aa  935    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  43.34 
 
 		 1312 aa  979    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  72.48 
 
 		 1298 aa  1939    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  42.7 
 
 		 1296 aa  1009    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1375 aa  1438    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  56.27 
 
 		 1462 aa  1438    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  45.71 
 
 		 1376 aa  914    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  69.84 
 
 		 1402 aa  1934    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  52.58 
 
 		 1428 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  42.17 
 
 		 1291 aa  982    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1375 aa  1438    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.55 
 
 		 1295 aa  1014    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  41.56 
 
 		 1325 aa  951    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  40.09 
 
 		 1308 aa  956    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  35.09 
 
 		 1421 aa  786    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  55.74 
 
 		 1316 aa  1442    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  36.81 
 
 		 1466 aa  776    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.67 
 
 		 1306 aa  1033    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  56.44 
 
 		 1402 aa  1440    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.45 
 
 		 1300 aa  1017    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  36.71 
 
 		 1231 aa  691    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  40.32 
 
 		 1307 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.67 
 
 		 1300 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  56.02 
 
 		 1375 aa  1437    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.44 
 
 		 1303 aa  969    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  43.21 
 
 		 1295 aa  1028    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  71.65 
 
 		 1341 aa  1925    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.67 
 
 		 1306 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  40.81 
 
 		 1318 aa  942    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  43.67 
 
 		 1341 aa  986    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  38.68 
 
 		 1373 aa  785    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0877  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1363 aa  2751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0749842  normal  0.69744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  55.73 
 
 		 1222 aa  1341    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  43.39 
 
 		 1326 aa  944    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  39.36 
 
 		 1326 aa  915    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  56.44 
 
 		 1314 aa  1441    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  38.42 
 
 		 1309 aa  832    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.14 
 
 		 1345 aa  1004    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  40.16 
 
 		 1305 aa  884    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  52.33 
 
 		 1320 aa  818    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  39.67 
 
 		 1336 aa  914    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.59 
 
 		 1306 aa  1031    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  44.31 
 
 		 1339 aa  1018    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  39.77 
 
 		 1282 aa  814    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  43.39 
 
 		 1289 aa  1014    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  56.09 
 
 		 1375 aa  1438    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  41.26 
 
 		 1338 aa  917    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.67 
 
 		 1306 aa  1032    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>