More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0651 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  36.8 
 
 		 1438 aa  827    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  97.68 
 
 		 1478 aa  2882    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  100 
 
 		 1466 aa  2974    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  33.29 
 
 		 1566 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  39.59 
 
 		 1560 aa  694    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  40.79 
 
 		 1338 aa  944    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  36.71 
 
 		 1391 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  38.01 
 
 		 1351 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  39.97 
 
 		 1374 aa  909    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  66.15 
 
 		 1360 aa  1856    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  68.87 
 
 		 1373 aa  1942    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  36.79 
 
 		 1378 aa  630  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  51.71 
 
 		 1281 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  53.11 
 
 		 1355 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  49.69 
 
 		 1282 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  50.77 
 
 		 1308 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  51.74 
 
 		 1295 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  47.1 
 
 		 1326 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  51.22 
 
 		 1318 aa  612  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  46.92 
 
 		 1326 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  51.4 
 
 		 1296 aa  612  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  50 
 
 		 1291 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  51.46 
 
 		 1295 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  50.85 
 
 		 1293 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  54.31 
 
 		 1290 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  52.27 
 
 		 1293 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  51.25 
 
 		 1318 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  51.13 
 
 		 1291 aa  606  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  52.43 
 
 		 1293 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  51.48 
 
 		 1312 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  52.43 
 
 		 1293 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  44.01 
 
 		 1290 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  51.75 
 
 		 1291 aa  602  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  49.35 
 
 		 1303 aa  603  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  49.5 
 
 		 1303 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  52.88 
 
 		 1306 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  53.25 
 
 		 1303 aa  602  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  51.94 
 
 		 1293 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  51.94 
 
 		 1293 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  52.27 
 
 		 1291 aa  603  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  51.92 
 
 		 1289 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  49.77 
 
 		 1293 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  49.31 
 
 		 1295 aa  599  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  47.94 
 
 		 1342 aa  599  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  51.78 
 
 		 1293 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  41.22 
 
 		 1298 aa  599  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.07 
 
 		 1300 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  48.07 
 
 		 1300 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50.33 
 
 		 1295 aa  594  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.2 
 
 		 1306 aa  596  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.05 
 
 		 1306 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  52.45 
 
 		 1296 aa  595  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50.49 
 
 		 1295 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.35 
 
 		 1306 aa  596  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.2 
 
 		 1306 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.2 
 
 		 1300 aa  596  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.07 
 
 		 1300 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.07 
 
 		 1300 aa  592  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.92 
 
 		 1300 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  50.33 
 
 		 1281 aa  592  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50 
 
 		 1300 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.07 
 
 		 1300 aa  593  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50.33 
 
 		 1300 aa  592  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  51.09 
 
 		 1291 aa  592  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  48.01 
 
 		 1309 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  47.09 
 
 		 1328 aa  592  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.78 
 
 		 1345 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  49.45 
 
 		 1310 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  52.14 
 
 		 1329 aa  589  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  50.62 
 
 		 1307 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  50.77 
 
 		 1301 aa  589  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  52.34 
 
 		 1298 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.52 
 
 		 1303 aa  588  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50.17 
 
 		 1295 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  47.91 
 
 		 1294 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  50.16 
 
 		 1295 aa  586  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  51.62 
 
 		 1324 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  51.22 
 
 		 1311 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  49.41 
 
 		 1341 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  53.14 
 
 		 1378 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  51.81 
 
 		 1333 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  55.38 
 
 		 1275 aa  582  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  52 
 
 		 1303 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  50.08 
 
 		 1316 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  52.03 
 
 		 1316 aa  583  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  54.14 
 
 		 1375 aa  583  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  50.15 
 
 		 1301 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  50 
 
 		 1301 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  52.25 
 
 		 1462 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  48.6 
 
 		 1411 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  52.14 
 
 		 1310 aa  580  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  49.85 
 
 		 1301 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  49.24 
 
 		 1295 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  48.96 
 
 		 1339 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>