More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19937 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  53.85 
 
 		 1128 aa  922    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  50.24 
 
 		 924 aa  660    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  55.47 
 
 		 1241 aa  731    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  55.87 
 
 		 1135 aa  750    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  49.85 
 
 		 720 aa  641    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  53.4 
 
 		 1075 aa  924    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  56.31 
 
 		 1189 aa  755    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  49 
 
 		 1261 aa  658    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  57.26 
 
 		 873 aa  982    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  100 
 
 		 1012 aa  2102    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  50.3 
 
 		 697 aa  673    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  49.1 
 
 		 989 aa  677    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  48.63 
 
 		 769 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  50.15 
 
 		 771 aa  619  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  49.03 
 
 		 783 aa  615  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  45.85 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  45 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  43.4 
 
 		 670 aa  516  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  42.83 
 
 		 724 aa  491  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  40.27 
 
 		 713 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  39.71 
 
 		 830 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  42.92 
 
 		 665 aa  461  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  37.69 
 
 		 1290 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  52.5 
 
 		 422 aa  429  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  35.42 
 
 		 824 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  36.92 
 
 		 1307 aa  419  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  38.2 
 
 		 1303 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  38.54 
 
 		 1303 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.6 
 
 		 1303 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  37.56 
 
 		 1326 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  37.7 
 
 		 1326 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  37.04 
 
 		 651 aa  412  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  37.26 
 
 		 1275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  37.6 
 
 		 1282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  36.91 
 
 		 1294 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  36.87 
 
 		 1338 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  37.72 
 
 		 1312 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  35.96 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  37.19 
 
 		 1281 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  35.69 
 
 		 1293 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  38.38 
 
 		 1310 aa  399  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  36.9 
 
 		 1295 aa  399  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  36.32 
 
 		 1293 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  36.18 
 
 		 1293 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1293 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1291 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  37.86 
 
 		 1318 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  38.44 
 
 		 1301 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  36.82 
 
 		 1305 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  36.32 
 
 		 1293 aa  399  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  37.23 
 
 		 1312 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  37.89 
 
 		 1301 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  37.89 
 
 		 1301 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  35.25 
 
 		 814 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  37.03 
 
 		 1303 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 		 1324 aa  396  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  37.89 
 
 		 1301 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1293 aa  396  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  37.21 
 
 		 1289 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  37.29 
 
 		 1296 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  36.49 
 
 		 1298 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  35.88 
 
 		 1293 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  36.34 
 
 		 1295 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  36.62 
 
 		 1329 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  34.81 
 
 		 1306 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.38 
 
 		 1290 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  37.56 
 
 		 1289 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  36.47 
 
 		 1293 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  36.74 
 
 		 1310 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35.77 
 
 		 1328 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  37.69 
 
 		 1329 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  35.5 
 
 		 1291 aa  389  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  36.51 
 
 		 1307 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.71 
 
 		 1345 aa  385  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 		 1316 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  35.91 
 
 		 1411 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  36.42 
 
 		 1312 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  36.43 
 
 		 1342 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  35.15 
 
 		 1308 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  36.93 
 
 		 1298 aa  386  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  36.51 
 
 		 1306 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.88 
 
 		 1298 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37 
 
 		 1303 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  34.55 
 
 		 1341 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 		 1291 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  36.32 
 
 		 1324 aa  383  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  35.96 
 
 		 1291 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  36.47 
 
 		 1315 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  36.27 
 
 		 1291 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  35.99 
 
 		 1282 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  37.19 
 
 		 1311 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.4 
 
 		 1295 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  36.16 
 
 		 1296 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  36.08 
 
 		 1317 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.87 
 
 		 1295 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.14 
 
 		 1295 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1325 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.35 
 
 		 1339 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  35.66 
 
 		 1316 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.93 
 
 		 1309 aa  376  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>