More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51921 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  74.64 
 
 		 1135 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  100 
 
 		 422 aa  877    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  70.21 
 
 		 1189 aa  631  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  67.46 
 
 		 1241 aa  614  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  56.66 
 
 		 873 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  52.31 
 
 		 1075 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  54.36 
 
 		 1128 aa  439  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  52.5 
 
 		 1012 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  53.68 
 
 		 924 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  51.55 
 
 		 1261 aa  422  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  47.99 
 
 		 989 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  51.39 
 
 		 697 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  49.5 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  50.13 
 
 		 783 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  50.38 
 
 		 769 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  49.23 
 
 		 771 aa  354  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  46.33 
 
 		 699 aa  345  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.01 
 
 		 679 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  42.31 
 
 		 670 aa  315  9e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  41.29 
 
 		 713 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  37.53 
 
 		 724 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  37.98 
 
 		 824 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  38.38 
 
 		 651 aa  260  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  41.9 
 
 		 665 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.39 
 
 		 1312 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  36.25 
 
 		 814 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 		 1298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.73 
 
 		 1294 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  33.74 
 
 		 811 aa  232  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  34.91 
 
 		 1290 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.33 
 
 		 1298 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  35.34 
 
 		 1303 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  33.25 
 
 		 870 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  34.65 
 
 		 1301 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  34.65 
 
 		 1301 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  33.76 
 
 		 1328 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1329 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  35.28 
 
 		 1312 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  34.37 
 
 		 1281 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1375 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1375 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1375 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  226  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1375 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  34.81 
 
 		 1289 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.08 
 
 		 1295 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.08 
 
 		 1295 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  34.34 
 
 		 1315 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.76 
 
 		 1309 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 		 1301 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1345 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1428 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.28 
 
 		 1300 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  33.85 
 
 		 1462 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.59 
 
 		 1295 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1296 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 		 1320 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  34.53 
 
 		 1303 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 		 1301 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  34.43 
 
 		 1281 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  34.09 
 
 		 1306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  33.51 
 
 		 1282 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1306 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1306 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1306 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1306 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.51 
 
 		 1300 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  33.75 
 
 		 1326 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  33.25 
 
 		 1326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  33.07 
 
 		 1380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  34.72 
 
 		 1310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  33.81 
 
 		 1338 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  34.55 
 
 		 1303 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 1295 aa  219  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  33.94 
 
 		 1293 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  34.03 
 
 		 1293 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 		 1303 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  33.69 
 
 		 1305 aa  219  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  34.03 
 
 		 1293 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  34.03 
 
 		 1293 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  35.23 
 
 		 1324 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  33.16 
 
 		 1318 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  32.31 
 
 		 1307 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  34.6 
 
 		 1339 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  33.68 
 
 		 1291 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.25 
 
 		 1295 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.91 
 
 		 1295 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.99 
 
 		 1295 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  33.68 
 
 		 1293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  33.68 
 
 		 1293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.1 
 
 		 1290 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  33.77 
 
 		 1293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>