More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02340 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1295 aa  2646    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  43.58 
 
 
1270 aa  725    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  48.89 
 
 
956 aa  626  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  32.65 
 
 
989 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  32.61 
 
 
924 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  30.85 
 
 
873 aa  340  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  31.69 
 
 
713 aa  321  6e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  30.17 
 
 
1329 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  29.37 
 
 
1316 aa  291  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  29.32 
 
 
1560 aa  288  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  40.17 
 
 
1153 aa  287  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  30.13 
 
 
699 aa  287  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  29.03 
 
 
1324 aa  286  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  29.69 
 
 
1326 aa  285  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  29.43 
 
 
1349 aa  283  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  29.09 
 
 
1331 aa  281  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  30.22 
 
 
1041 aa  278  7e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  32.75 
 
 
1560 aa  270  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  29.15 
 
 
1355 aa  269  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  29.08 
 
 
1323 aa  268  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  28.45 
 
 
1336 aa  267  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  28.39 
 
 
1320 aa  264  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  28.54 
 
 
1428 aa  262  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  27.7 
 
 
1375 aa  258  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  27.7 
 
 
1375 aa  258  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  27.7 
 
 
1375 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  47.7 
 
 
511 aa  251  9e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  32.03 
 
 
1466 aa  250  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  32.38 
 
 
790 aa  249  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  29.01 
 
 
1378 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  33.63 
 
 
1261 aa  235  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  27.61 
 
 
1303 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  27.83 
 
 
1407 aa  233  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  27.76 
 
 
1303 aa  233  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  34.6 
 
 
1135 aa  232  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  35.31 
 
 
1624 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  27.66 
 
 
1301 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  27.82 
 
 
1301 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  26.97 
 
 
1307 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  30.59 
 
 
1325 aa  222  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  28.17 
 
 
651 aa  221  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  27.6 
 
 
1301 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  27.57 
 
 
1301 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  33.33 
 
 
422 aa  218  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  32.56 
 
 
1012 aa  217  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  33.18 
 
 
1189 aa  217  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  31.81 
 
 
1075 aa  215  5.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  32.88 
 
 
697 aa  212  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  31.98 
 
 
679 aa  212  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  29.64 
 
 
1374 aa  207  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  31.65 
 
 
1241 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  30.54 
 
 
1128 aa  201  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  32.74 
 
 
720 aa  200  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  32.9 
 
 
861 aa  199  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  32.79 
 
 
1297 aa  199  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  31.5 
 
 
1294 aa  197  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  28.73 
 
 
1288 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  32.18 
 
 
769 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  31.9 
 
 
783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  30.79 
 
 
1324 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  30.59 
 
 
891 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  31.76 
 
 
1298 aa  191  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  32.21 
 
 
771 aa  190  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  30.02 
 
 
1423 aa  190  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  29.82 
 
 
1329 aa  190  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  30.61 
 
 
833 aa  190  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  32.41 
 
 
1312 aa  188  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  30.43 
 
 
1311 aa  188  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  30.92 
 
 
1312 aa  187  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  30.8 
 
 
824 aa  185  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  30.92 
 
 
1312 aa  185  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  30.97 
 
 
1315 aa  186  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.15 
 
 
1303 aa  185  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  30.72 
 
 
1306 aa  184  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  30.35 
 
 
1375 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  30.06 
 
 
833 aa  183  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  30.31 
 
 
1303 aa  183  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  30.98 
 
 
1281 aa  181  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.13 
 
 
1290 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  28.74 
 
 
1435 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.41 
 
 
1300 aa  179  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  28.51 
 
 
1281 aa  179  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  31.14 
 
 
1295 aa  179  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.51 
 
 
1300 aa  179  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.51 
 
 
1300 aa  179  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  29.98 
 
 
1308 aa  178  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  28.51 
 
 
1300 aa  179  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  29.98 
 
 
1275 aa  178  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.51 
 
 
1300 aa  179  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.51 
 
 
1300 aa  178  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0228  ATP-dependent helicase HrpA  29.4 
 
 
1471 aa  178  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.406446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  30.98 
 
 
1290 aa  177  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.29 
 
 
1300 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  29.7 
 
 
1339 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  29.75 
 
 
1282 aa  177  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.52 
 
 
1295 aa  176  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.52 
 
 
1295 aa  176  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  29.22 
 
 
1376 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  30.02 
 
 
1282 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.29 
 
 
1300 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>