More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1858 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0839  ATP-dependent helicase HrpB  53.56 
 
 		 860 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0787  ATP-dependent helicase HrpB  53.97 
 
 		 860 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0835  ATP-dependent helicase HrpB  53.45 
 
 		 860 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 891 aa  1712    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0833  ATP-dependent helicase HrpB  52.64 
 
 		 921 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  40.96 
 
 		 842 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  40.52 
 
 		 846 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  39.64 
 
 		 844 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  39.01 
 
 		 842 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3359  helicase  37.84 
 
 		 865 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0429272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  39.07 
 
 		 828 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  39.73 
 
 		 827 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  38.45 
 
 		 842 aa  446  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  37.7 
 
 		 829 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  38.65 
 
 		 842 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  36.29 
 
 		 798 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  37.22 
 
 		 825 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  40.79 
 
 		 838 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  36.91 
 
 		 840 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  38.05 
 
 		 839 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  38.45 
 
 		 870 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  40.36 
 
 		 838 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  35.91 
 
 		 861 aa  421  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  37.97 
 
 		 872 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  37.77 
 
 		 824 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  33.59 
 
 		 826 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  37.87 
 
 		 844 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  38.63 
 
 		 844 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  35.2 
 
 		 864 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  31.88 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  38.91 
 
 		 842 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  38.36 
 
 		 842 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  39.6 
 
 		 844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  36.84 
 
 		 825 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  39.73 
 
 		 808 aa  406  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  38.06 
 
 		 833 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  39.58 
 
 		 808 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  37 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  38.88 
 
 		 824 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  39.44 
 
 		 834 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  38.96 
 
 		 808 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  37.02 
 
 		 841 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  37.39 
 
 		 826 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  39.31 
 
 		 837 aa  393  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  38.18 
 
 		 825 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  36.75 
 
 		 822 aa  389  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  35.66 
 
 		 833 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  36.56 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  38.19 
 
 		 830 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  38.19 
 
 		 917 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  37.63 
 
 		 832 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  34.83 
 
 		 825 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  30.13 
 
 		 823 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  36.28 
 
 		 821 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  39.6 
 
 		 850 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  36.71 
 
 		 829 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  35.32 
 
 		 833 aa  369  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  34.43 
 
 		 822 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  38.9 
 
 		 848 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31 
 
 		 833 aa  364  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  36.94 
 
 		 830 aa  364  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  35.19 
 
 		 820 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  34.84 
 
 		 818 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  35.43 
 
 		 821 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  34.63 
 
 		 834 aa  363  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  30.6 
 
 		 848 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  34.81 
 
 		 821 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  34 
 
 		 821 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  36.21 
 
 		 936 aa  356  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  37.83 
 
 		 860 aa  354  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  31.53 
 
 		 835 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  36.65 
 
 		 823 aa  353  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  36.81 
 
 		 814 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  38.35 
 
 		 802 aa  352  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.03 
 
 		 820 aa  350  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  31.75 
 
 		 835 aa  350  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  31.53 
 
 		 835 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0595  ATP-dependent helicase HrpB  38.27 
 
 		 821 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.420753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  36.27 
 
 		 772 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  31.2 
 
 		 835 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  34.39 
 
 		 900 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  33.92 
 
 		 863 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  31.59 
 
 		 869 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.3 
 
 		 814 aa  333  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  29.99 
 
 		 855 aa  331  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  31.26 
 
 		 842 aa  330  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3271  ATP-dependent helicase HrpB  31.63 
 
 		 848 aa  330  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3165  ATP-dependent helicase HrpB  31.37 
 
 		 850 aa  327  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4302  ATP-dependent helicase HrpB  29.21 
 
 		 845 aa  327  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  37.79 
 
 		 836 aa  326  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3124  ATP-dependent helicase HrpB  31.64 
 
 		 843 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000637258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.52 
 
 		 820 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.29 
 
 		 821 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0369  ATP-dependent helicase HrpB  34.23 
 
 		 834 aa  324  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  30.69 
 
 		 856 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  36.04 
 
 		 830 aa  321  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  30.48 
 
 		 854 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  30.51 
 
 		 856 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  34.27 
 
 		 841 aa  319  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2491  ATP-dependent helicase  32.31 
 
 		 718 aa  317  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.041451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>