More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0369 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0369  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 834 aa  1647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  67.75 
 
 		 834 aa  1074    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.07 
 
 		 853 aa  829    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  41.87 
 
 		 846 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  43.08 
 
 		 832 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.4 
 
 		 833 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  40.16 
 
 		 842 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  39.71 
 
 		 827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  39.67 
 
 		 828 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  39.19 
 
 		 822 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  38.76 
 
 		 864 aa  502  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  40.12 
 
 		 818 aa  502  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  39.73 
 
 		 824 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  40.36 
 
 		 825 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  40.68 
 
 		 844 aa  499  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  39.57 
 
 		 825 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  40.65 
 
 		 842 aa  499  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  40.24 
 
 		 832 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  39.49 
 
 		 820 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  39.74 
 
 		 842 aa  492  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  38.65 
 
 		 829 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  39.21 
 
 		 825 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  37.49 
 
 		 848 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  37.43 
 
 		 877 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  40.88 
 
 		 824 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  39.88 
 
 		 844 aa  479  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  37.6 
 
 		 872 aa  479  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  43.63 
 
 		 860 aa  479  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0130  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.09 
 
 		 820 aa  478  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  39.98 
 
 		 837 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  38.94 
 
 		 822 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0488  ATP-dependent helicase HrpB  38.16 
 
 		 823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.531683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  39.26 
 
 		 821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  40.38 
 
 		 798 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  37.76 
 
 		 870 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  41.3 
 
 		 848 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.1 
 
 		 812 aa  465  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  40.75 
 
 		 917 aa  465  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  41.13 
 
 		 830 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  41.32 
 
 		 826 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  39.38 
 
 		 809 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  39.38 
 
 		 809 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3886  ATP-dependent helicase HrpB  39.67 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.9 
 
 		 812 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  37.74 
 
 		 821 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  39.95 
 
 		 825 aa  459  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.34 
 
 		 809 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  39.16 
 
 		 802 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  41.31 
 
 		 838 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.34 
 
 		 834 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  40.61 
 
 		 838 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.14 
 
 		 809 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.1 
 
 		 824 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  35.3 
 
 		 826 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.34 
 
 		 853 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  35.34 
 
 		 823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.26 
 
 		 824 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.34 
 
 		 829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  40 
 
 		 842 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  37.72 
 
 		 821 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  36.97 
 
 		 821 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  40.12 
 
 		 842 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  35.49 
 
 		 821 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  38.43 
 
 		 840 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  39.34 
 
 		 823 aa  452  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.23 
 
 		 824 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.26 
 
 		 809 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.23 
 
 		 824 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.02 
 
 		 824 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.23 
 
 		 824 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  39.98 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.6 
 
 		 814 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.81 
 
 		 820 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  39.02 
 
 		 824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  38.83 
 
 		 839 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  38.67 
 
 		 863 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  38.34 
 
 		 841 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  37.53 
 
 		 833 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  37.65 
 
 		 833 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  38.19 
 
 		 900 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  39.14 
 
 		 837 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.06 
 
 		 825 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  39.49 
 
 		 844 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  39.07 
 
 		 808 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  39 
 
 		 798 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  38.34 
 
 		 822 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.88 
 
 		 824 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  39.11 
 
 		 824 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  40.07 
 
 		 829 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  36.6 
 
 		 849 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  36.06 
 
 		 856 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  38.92 
 
 		 808 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  36.19 
 
 		 854 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  39.03 
 
 		 808 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  37.71 
 
 		 833 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.65 
 
 		 809 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  40.23 
 
 		 844 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  36.41 
 
 		 835 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  36.51 
 
 		 846 aa  436  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  39.02 
 
 		 814 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>