More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3972 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7166  ATP-dependent helicase HrpB  59.23 
 
 		 885 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236213  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07780  ATP-dependent helicase HrpB  57.18 
 
 		 830 aa  755    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18990  ATP-dependent helicase HrpB  56.64 
 
 		 839 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.127417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6512  ATP-dependent helicase HrpB  55.7 
 
 		 862 aa  735    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0785  ATP-dependent helicase HrpB  54.37 
 
 		 880 aa  719    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1727  ATP-dependent helicase HrpB  57.78 
 
 		 856 aa  773    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69515  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1744  ATP-dependent helicase HrpB  58.42 
 
 		 855 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564063  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1990  ATP-dependent helicase HrpB  57.09 
 
 		 843 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00135733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1244  ATP-dependent helicase HrpB  57.47 
 
 		 836 aa  756    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00036267  normal  0.131071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 841 aa  1623    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0951  ATP-dependent helicase HrpB  54.93 
 
 		 772 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2026  ATP-dependent helicase HrpB  46.25 
 
 		 897 aa  578  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.79914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1784  ATP-dependent helicase HrpB  46.41 
 
 		 871 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000613438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  39.91 
 
 		 842 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  41.75 
 
 		 827 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  40.62 
 
 		 844 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  42.66 
 
 		 846 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  40.96 
 
 		 828 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03650  ATP-dependent helicase HrpB  46.14 
 
 		 861 aa  514  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  42.97 
 
 		 838 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  41.11 
 
 		 825 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  40.75 
 
 		 842 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  37.26 
 
 		 826 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  40.98 
 
 		 842 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  42.84 
 
 		 826 aa  498  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  40.71 
 
 		 839 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  41.65 
 
 		 824 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  38 
 
 		 842 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  40.98 
 
 		 842 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  38.56 
 
 		 840 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  40.37 
 
 		 844 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  44.27 
 
 		 848 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  41.1 
 
 		 824 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  40.14 
 
 		 844 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  39.64 
 
 		 798 aa  489  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  42.33 
 
 		 837 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  40.49 
 
 		 844 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  38.9 
 
 		 825 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  42.14 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  40.07 
 
 		 829 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  40.89 
 
 		 825 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  39.42 
 
 		 872 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  40.72 
 
 		 821 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  42.74 
 
 		 847 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  38.03 
 
 		 818 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  40 
 
 		 820 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  39.78 
 
 		 821 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  40.45 
 
 		 842 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  39.28 
 
 		 870 aa  476  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  37.21 
 
 		 864 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  39.13 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.47 
 
 		 812 aa  472  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  41.6 
 
 		 837 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  38.63 
 
 		 832 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  40.47 
 
 		 830 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  39.69 
 
 		 821 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  38.93 
 
 		 877 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  41.38 
 
 		 814 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  41.03 
 
 		 830 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  38.43 
 
 		 833 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  40.98 
 
 		 863 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  34.22 
 
 		 869 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  41.39 
 
 		 832 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  42.19 
 
 		 850 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  41.24 
 
 		 825 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  42.12 
 
 		 808 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  41.94 
 
 		 808 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.59 
 
 		 824 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.23 
 
 		 809 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.47 
 
 		 824 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  42.36 
 
 		 808 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.23 
 
 		 824 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  40.82 
 
 		 823 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  41.63 
 
 		 834 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  37.11 
 
 		 809 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  37.35 
 
 		 824 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  35.3 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.25 
 
 		 834 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  38.43 
 
 		 822 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.25 
 
 		 853 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.23 
 
 		 809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.25 
 
 		 829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  40.54 
 
 		 826 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  40.21 
 
 		 841 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  37.23 
 
 		 809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  35.61 
 
 		 835 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  35.43 
 
 		 835 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  39.86 
 
 		 833 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  37.11 
 
 		 809 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  35.54 
 
 		 835 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.22 
 
 		 812 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  34.94 
 
 		 849 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04570  ATP-dependent helicase HrpB  45.44 
 
 		 893 aa  445  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0937803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  40.47 
 
 		 829 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  33.77 
 
 		 833 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  34.69 
 
 		 856 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  41.33 
 
 		 860 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  34.04 
 
 		 846 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  34.69 
 
 		 854 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  40.07 
 
 		 821 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>