More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1633 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1633  Helicase ATP-dependent domain protein  100 
 
 		 861 aa  1723    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3359  helicase  41.88 
 
 		 865 aa  620  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0429272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  35.72 
 
 		 827 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  35.34 
 
 		 828 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  34.76 
 
 		 846 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  35.44 
 
 		 842 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  34.22 
 
 		 842 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  33.88 
 
 		 870 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  30.89 
 
 		 835 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  34.81 
 
 		 824 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  34.15 
 
 		 829 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  35.76 
 
 		 842 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  35.12 
 
 		 872 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  34.26 
 
 		 825 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  34.97 
 
 		 798 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  33.98 
 
 		 877 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  33.95 
 
 		 825 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  35.13 
 
 		 891 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  33.22 
 
 		 833 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  33.84 
 
 		 844 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  33.8 
 
 		 826 aa  392  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  33.83 
 
 		 821 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  35.02 
 
 		 824 aa  389  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3886  ATP-dependent helicase HrpB  35.14 
 
 		 834 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.25 
 
 		 821 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  33.29 
 
 		 833 aa  386  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  35.14 
 
 		 837 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  33.26 
 
 		 820 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  33.6 
 
 		 832 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  36.31 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0787  ATP-dependent helicase HrpB  35.9 
 
 		 860 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  33.22 
 
 		 818 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  36.31 
 
 		 854 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  32.16 
 
 		 822 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  35.72 
 
 		 830 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0839  ATP-dependent helicase HrpB  35.73 
 
 		 860 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0835  ATP-dependent helicase HrpB  35.94 
 
 		 860 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  35.73 
 
 		 848 aa  373  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  31.9 
 
 		 825 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  33.06 
 
 		 844 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.55 
 
 		 833 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  33.86 
 
 		 826 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  31.56 
 
 		 840 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  34.9 
 
 		 838 aa  366  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  31.04 
 
 		 822 aa  366  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  36.67 
 
 		 850 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  36.55 
 
 		 847 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.81 
 
 		 809 aa  363  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  33.85 
 
 		 917 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  33.56 
 
 		 842 aa  361  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4194  ATP-dependent helicase HrpB  30.26 
 
 		 823 aa  361  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  33.22 
 
 		 864 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3407  ATP-dependent helicase HrpB  30.88 
 
 		 835 aa  360  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.982669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0622  ATP-dependent helicase HrpB  30.96 
 
 		 835 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0623  ATP-dependent helicase HrpB  30.96 
 
 		 835 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  32.17 
 
 		 824 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  32.67 
 
 		 821 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  33.41 
 
 		 838 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  30.76 
 
 		 835 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  31.9 
 
 		 832 aa  357  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0655  ATP-dependent helicase HrpB  31.48 
 
 		 846 aa  356  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  32.56 
 
 		 824 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.93 
 
 		 824 aa  356  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.93 
 
 		 824 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  32.05 
 
 		 824 aa  355  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  34.36 
 
 		 823 aa  354  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  33.37 
 
 		 842 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  33.26 
 
 		 842 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  33.68 
 
 		 844 aa  350  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  35.77 
 
 		 829 aa  349  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  32.22 
 
 		 821 aa  349  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3793  ATP-dependent helicase HrpB  31.61 
 
 		 842 aa  347  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000841118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.66 
 
 		 824 aa  346  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  34.36 
 
 		 936 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2322  ATP-dependent helicase HrpB  31.37 
 
 		 834 aa  344  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.334263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.72 
 
 		 825 aa  344  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0704  ATP-dependent helicase HrpB  30.29 
 
 		 869 aa  343  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  34.5 
 
 		 808 aa  343  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  34.53 
 
 		 825 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  33.57 
 
 		 814 aa  343  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  34.95 
 
 		 834 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  30.32 
 
 		 849 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  29.94 
 
 		 855 aa  341  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  34.03 
 
 		 808 aa  340  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  32.76 
 
 		 830 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  34.23 
 
 		 808 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  32.54 
 
 		 839 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3743  ATP-dependent helicase HrpB  30.15 
 
 		 856 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  33.18 
 
 		 837 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0582  ATP-dependent helicase HrpB  29.77 
 
 		 854 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0595  ATP-dependent helicase HrpB  36.36 
 
 		 821 aa  337  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.420753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3686  ATP-dependent helicase HrpB  30.05 
 
 		 856 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  32.72 
 
 		 844 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.97 
 
 		 820 aa  334  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  33.37 
 
 		 863 aa  333  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  32.22 
 
 		 822 aa  330  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3972  ATP-dependent helicase HrpB  33.03 
 
 		 841 aa  330  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3124  ATP-dependent helicase HrpB  29.57 
 
 		 843 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000637258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  32.1 
 
 		 841 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.73 
 
 		 812 aa  323  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>