More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0228 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  40.02 
 
 		 1378 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  39.85 
 
 		 1462 aa  891    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.96 
 
 		 1300 aa  885    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  36.39 
 
 		 1308 aa  681    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.28 
 
 		 1300 aa  897    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  40.18 
 
 		 1295 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  40.7 
 
 		 1291 aa  815    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.2 
 
 		 1295 aa  905    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3104  ATP-dependent helicase HrpA  47.85 
 
 		 1388 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.623202  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  41.94 
 
 		 1293 aa  823    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  45.19 
 
 		 1281 aa  895    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  45.1 
 
 		 1300 aa  892    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  40.82 
 
 		 1375 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  40.96 
 
 		 1375 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  38.99 
 
 		 1301 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.19 
 
 		 1300 aa  895    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  41.34 
 
 		 1294 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.86 
 
 		 1306 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  38.71 
 
 		 1375 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  41.67 
 
 		 1293 aa  823    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  41.39 
 
 		 1303 aa  937    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  39.4 
 
 		 1403 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  40.82 
 
 		 1375 aa  875    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  47.3 
 
 		 1441 aa  903    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.87 
 
 		 1309 aa  883    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  39.38 
 
 		 1301 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  48.39 
 
 		 1339 aa  919    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  39.88 
 
 		 1298 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  37.74 
 
 		 1333 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  40.95 
 
 		 1291 aa  807    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  40.11 
 
 		 1320 aa  886    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  41.84 
 
 		 1293 aa  824    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.2 
 
 		 1295 aa  905    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  40.97 
 
 		 1303 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.77 
 
 		 1306 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  37.55 
 
 		 1329 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  44.47 
 
 		 1324 aa  1032    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  38.62 
 
 		 1323 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  38.83 
 
 		 1275 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  37.43 
 
 		 1351 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 		 1375 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  39.75 
 
 		 1281 aa  771    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  41.2 
 
 		 1303 aa  934    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.01 
 
 		 1300 aa  890    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  39.66 
 
 		 1402 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  41.33 
 
 		 1295 aa  830    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  45.58 
 
 		 1375 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  35.38 
 
 		 1342 aa  666    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  38.15 
 
 		 1329 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  41.11 
 
 		 1380 aa  875    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  42.02 
 
 		 1293 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  48.74 
 
 		 1355 aa  1179    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  42.74 
 
 		 1345 aa  884    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  46.53 
 
 		 1307 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  38.09 
 
 		 1298 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  38.28 
 
 		 1296 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.01 
 
 		 1300 aa  890    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  40.82 
 
 		 1375 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  37.7 
 
 		 1376 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  39.08 
 
 		 1402 aa  844    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  39.75 
 
 		 1428 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  40.39 
 
 		 1291 aa  801    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  38.99 
 
 		 1301 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  43.07 
 
 		 1326 aa  946    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  41.73 
 
 		 1325 aa  743    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  45.28 
 
 		 1300 aa  895    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.86 
 
 		 1300 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  38.75 
 
 		 1316 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  38.85 
 
 		 1301 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  41.88 
 
 		 1293 aa  815    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  39.35 
 
 		 1402 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  41.38 
 
 		 1282 aa  837    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  46.91 
 
 		 1317 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  41.74 
 
 		 1338 aa  942    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  40.78 
 
 		 1303 aa  851    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  41.76 
 
 		 1293 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  41.58 
 
 		 1293 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  41.86 
 
 		 1341 aa  725    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  40.27 
 
 		 1291 aa  802    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  38.6 
 
 		 1222 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  41.51 
 
 		 1326 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  47.98 
 
 		 1326 aa  1204    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  39.35 
 
 		 1314 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  44.78 
 
 		 1378 aa  869    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  39.39 
 
 		 1305 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  41.76 
 
 		 1293 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  48.12 
 
 		 1339 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  46.57 
 
 		 1282 aa  827    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  42.45 
 
 		 1289 aa  830    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  37.17 
 
 		 1330 aa  816    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.09 
 
 		 1295 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  42 
 
 		 1296 aa  857    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  46.95 
 
 		 1310 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  38.79 
 
 		 1312 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.86 
 
 		 1306 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  38.36 
 
 		 1306 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  40.92 
 
 		 1318 aa  832    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  40.82 
 
 		 1375 aa  875    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  44.77 
 
 		 1306 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  42.88 
 
 		 1312 aa  730    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>