More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42421 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  48.93 
 
 		 1128 aa  684    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  58.27 
 
 		 924 aa  1060    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  45.1 
 
 		 1241 aa  756    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  49.1 
 
 		 1012 aa  677    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  48.27 
 
 		 1075 aa  665    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  45.38 
 
 		 1189 aa  741    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  56.39 
 
 		 1261 aa  1082    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  49.77 
 
 		 873 aa  671    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  43.54 
 
 		 1135 aa  758    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  100 
 
 		 989 aa  2075    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  46.02 
 
 		 697 aa  615  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  42.78 
 
 		 769 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  46.54 
 
 		 783 aa  595  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  44.55 
 
 		 720 aa  582  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  43.92 
 
 		 771 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  42.05 
 
 		 699 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  43.4 
 
 		 724 aa  528  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  41.53 
 
 		 679 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  41.1 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  40.27 
 
 		 713 aa  479  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  39.17 
 
 		 665 aa  438  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  38.51 
 
 		 651 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  37.66 
 
 		 1298 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  36.04 
 
 		 1294 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  47.99 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 		 1293 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  35.85 
 
 		 1293 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  36.2 
 
 		 1291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  35.29 
 
 		 1318 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  35.5 
 
 		 1290 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.12 
 
 		 1290 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 		 1293 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  36.18 
 
 		 830 aa  409  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  35.43 
 
 		 1293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  34.24 
 
 		 1324 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  33.52 
 
 		 824 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  35.89 
 
 		 1293 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.6 
 
 		 1345 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.05 
 
 		 1324 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  35.71 
 
 		 1315 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  35.78 
 
 		 1281 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1326 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 		 1307 aa  406  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  36.92 
 
 		 1311 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  35.43 
 
 		 1293 aa  406  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  36.67 
 
 		 1349 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1305 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  35.43 
 
 		 1293 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.26 
 
 		 1312 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 		 1328 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  35.89 
 
 		 1293 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  35.51 
 
 		 1326 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  36.06 
 
 		 1296 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  34.86 
 
 		 814 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.1 
 
 		 1298 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  34.75 
 
 		 1303 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  34.76 
 
 		 1329 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  35.92 
 
 		 1297 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  36.57 
 
 		 1291 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  35.34 
 
 		 1329 aa  396  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  35.04 
 
 		 1291 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.93 
 
 		 1309 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  36.28 
 
 		 1306 aa  396  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.1 
 
 		 1282 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.02 
 
 		 1312 aa  396  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  35.71 
 
 		 1289 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  35.86 
 
 		 1303 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  35.71 
 
 		 1303 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 		 1303 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  36.67 
 
 		 1295 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  36.5 
 
 		 1325 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.64 
 
 		 1295 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  34.87 
 
 		 1316 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  35.92 
 
 		 1291 aa  393  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  35.47 
 
 		 1295 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.33 
 
 		 1295 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  35.14 
 
 		 1339 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  34.84 
 
 		 1339 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 		 1310 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.13 
 
 		 1295 aa  389  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  35.7 
 
 		 1308 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.05 
 
 		 1295 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  36.72 
 
 		 1301 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.7 
 
 		 1300 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 1295 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.04 
 
 		 1295 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  32.07 
 
 		 1342 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  34.12 
 
 		 1380 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  34.27 
 
 		 1310 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  34.39 
 
 		 1296 aa  386  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 		 1317 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  33.91 
 
 		 1282 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.05 
 
 		 1295 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 		 1375 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>