More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03920 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  50.62 
 
 
1241 aa  639    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  64.29 
 
 
769 aa  952    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 
783 aa  1637    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  64.12 
 
 
771 aa  889    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  60.14 
 
 
720 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  65.02 
 
 
697 aa  878    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  51.61 
 
 
1135 aa  653    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  49.54 
 
 
1189 aa  629  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  47.37 
 
 
873 aa  624  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  49.03 
 
 
1012 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  49 
 
 
1128 aa  610  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  47.62 
 
 
1261 aa  601  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  46.54 
 
 
989 aa  595  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  46.23 
 
 
924 aa  587  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  46.39 
 
 
1075 aa  580  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  44.22 
 
 
699 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.86 
 
 
679 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  45.37 
 
 
670 aa  530  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  42.18 
 
 
713 aa  502  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  41.69 
 
 
724 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  38.76 
 
 
830 aa  455  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  40.15 
 
 
665 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  38.54 
 
 
1298 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  37.16 
 
 
1312 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.68 
 
 
1309 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  35.98 
 
 
824 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  34.87 
 
 
1328 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.55 
 
 
1345 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  37.38 
 
 
814 aa  418  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.08 
 
 
1298 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  36.11 
 
 
1318 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.17 
 
 
1303 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  37.16 
 
 
1326 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  37.3 
 
 
1290 aa  416  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  36.91 
 
 
1296 aa  415  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  36.03 
 
 
1294 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 
1315 aa  412  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  37.41 
 
 
1325 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  36.59 
 
 
1326 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  38.43 
 
 
1311 aa  409  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.41 
 
 
1290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.89 
 
 
1282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.49 
 
 
1303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  36.9 
 
 
651 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  36.59 
 
 
1295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  36.57 
 
 
1295 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  36.87 
 
 
1303 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  37.12 
 
 
1303 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  35.93 
 
 
1281 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  36.85 
 
 
1310 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  36.74 
 
 
1293 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  36.74 
 
 
1293 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  35.7 
 
 
1281 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  36.59 
 
 
1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  36.73 
 
 
1303 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  36.63 
 
 
1293 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.8 
 
 
1295 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  36.01 
 
 
1339 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.8 
 
 
1295 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.64 
 
 
1306 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  36.22 
 
 
1291 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  36.74 
 
 
1293 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  35.95 
 
 
1291 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  36.52 
 
 
1293 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.79 
 
 
1306 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1300 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  36.58 
 
 
1289 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  36.7 
 
 
1307 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  36.02 
 
 
1338 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 
1293 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 
1324 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 
1275 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  36.52 
 
 
1306 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.77 
 
 
1339 aa  399  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.79 
 
 
1295 aa  399  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.64 
 
 
1306 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 
1293 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  35.62 
 
 
1296 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.64 
 
 
1306 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  36.21 
 
 
1291 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 
1318 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  36.78 
 
 
1324 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  37.03 
 
 
1317 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  36.87 
 
 
1312 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.64 
 
 
1300 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  37.32 
 
 
1301 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.44 
 
 
1295 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  35.99 
 
 
1316 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  37.91 
 
 
1301 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 
1308 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  37.32 
 
 
1301 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  35.6 
 
 
1291 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  37.46 
 
 
1301 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.65 
 
 
1295 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>