More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07030 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  100 
 
 
814 aa  1692    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  36.93 
 
 
679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  36.24 
 
 
1128 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  36.12 
 
 
1189 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  37.15 
 
 
783 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  35.72 
 
 
1135 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  36.12 
 
 
824 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  35.48 
 
 
1241 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  35.13 
 
 
989 aa  415  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  35.62 
 
 
830 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  35.51 
 
 
1075 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  34.09 
 
 
1261 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  35.47 
 
 
1012 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  35.8 
 
 
873 aa  411  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  35.67 
 
 
924 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  35.86 
 
 
697 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  34.44 
 
 
670 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  34.26 
 
 
720 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  35.18 
 
 
769 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  35.17 
 
 
771 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  34.38 
 
 
699 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  32.98 
 
 
713 aa  364  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  34.3 
 
 
665 aa  346  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  32.09 
 
 
724 aa  330  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  32.12 
 
 
1307 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31 
 
 
1306 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.69 
 
 
1300 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.69 
 
 
1300 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.55 
 
 
1300 aa  310  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31 
 
 
1306 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.55 
 
 
1300 aa  310  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.91 
 
 
1306 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  32.37 
 
 
1323 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  30.97 
 
 
1329 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.9 
 
 
1306 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  30.8 
 
 
1296 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  30.55 
 
 
1281 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.73 
 
 
1300 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  31.36 
 
 
1326 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  30.97 
 
 
1311 aa  308  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.44 
 
 
1281 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  30.41 
 
 
1300 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.55 
 
 
1300 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.5 
 
 
1309 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  31.44 
 
 
1326 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  31.95 
 
 
1316 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.41 
 
 
1300 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  32.43 
 
 
651 aa  305  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  31.5 
 
 
1290 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  31.3 
 
 
1303 aa  302  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.04 
 
 
1345 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.07 
 
 
1290 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  30.04 
 
 
1328 aa  300  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  31.07 
 
 
1315 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  31.23 
 
 
1303 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  30.73 
 
 
1275 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  31.54 
 
 
1296 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  31.23 
 
 
1303 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  31.57 
 
 
1303 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.7 
 
 
1295 aa  298  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  30.57 
 
 
1282 aa  297  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  31.93 
 
 
1298 aa  297  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  31.05 
 
 
1294 aa  296  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  30.56 
 
 
1329 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.42 
 
 
1295 aa  295  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  30.51 
 
 
1324 aa  295  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.43 
 
 
1300 aa  293  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  30.33 
 
 
1312 aa  293  8e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  30.78 
 
 
1342 aa  293  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  30.88 
 
 
1333 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  29.38 
 
 
1325 aa  292  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  29.62 
 
 
1318 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  30.74 
 
 
1310 aa  291  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  30.82 
 
 
1411 aa  291  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  30.33 
 
 
1380 aa  291  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  29.27 
 
 
1308 aa  291  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  30.7 
 
 
1341 aa  291  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  29.75 
 
 
1326 aa  291  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  30.38 
 
 
1462 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.31 
 
 
1298 aa  290  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.24 
 
 
1295 aa  290  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  29.9 
 
 
1282 aa  290  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.24 
 
 
1295 aa  290  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.43 
 
 
1303 aa  289  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  30.12 
 
 
1324 aa  289  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  31.25 
 
 
1301 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  30.41 
 
 
1293 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.98 
 
 
1295 aa  289  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  31.18 
 
 
1317 aa  289  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.51 
 
 
1295 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  30.83 
 
 
1301 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  31.17 
 
 
1295 aa  288  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  31.89 
 
 
1312 aa  287  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  29.92 
 
 
1375 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  30.66 
 
 
1295 aa  287  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  30.27 
 
 
1293 aa  287  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  29.92 
 
 
1375 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  29.92 
 
 
1375 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  29.82 
 
 
1428 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  30.72 
 
 
1338 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>