More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38697 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  100 
 
 
713 aa  1462    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  45.65 
 
 
699 aa  609  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  46.62 
 
 
670 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  45.37 
 
 
1128 aa  565  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  44.29 
 
 
697 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  42.63 
 
 
1241 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  42.75 
 
 
1189 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  42.56 
 
 
1075 aa  524  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  42.68 
 
 
1135 aa  513  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  41.87 
 
 
873 aa  509  1e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  42.32 
 
 
783 aa  504  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  43.03 
 
 
769 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  40.77 
 
 
679 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  41.7 
 
 
720 aa  495  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  42.69 
 
 
771 aa  487  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  40.45 
 
 
989 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  40.27 
 
 
1012 aa  470  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  38.77 
 
 
1261 aa  458  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  38.65 
 
 
924 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  39.71 
 
 
651 aa  426  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  38.23 
 
 
724 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  36.03 
 
 
830 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  36.14 
 
 
824 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  37.19 
 
 
665 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.58 
 
 
1290 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  35.24 
 
 
1298 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  35.83 
 
 
1310 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  35.59 
 
 
1303 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  35.77 
 
 
1315 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  32.11 
 
 
1342 aa  361  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1296 aa  360  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  32.71 
 
 
814 aa  360  5e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  34.9 
 
 
1306 aa  357  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  36.02 
 
 
1303 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  35.04 
 
 
1324 aa  354  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  34.15 
 
 
1275 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  33.97 
 
 
1289 aa  353  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  34.81 
 
 
1462 aa  353  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  32.73 
 
 
1291 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  34.8 
 
 
1326 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  35.08 
 
 
1338 aa  350  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  34.41 
 
 
1307 aa  350  7e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  34.52 
 
 
1326 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.38 
 
 
1309 aa  349  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 
1303 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  32.12 
 
 
1318 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  35.19 
 
 
1290 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  33.06 
 
 
1318 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  34.43 
 
 
1428 aa  348  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  34.09 
 
 
1303 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  33.88 
 
 
1281 aa  347  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  34.43 
 
 
1320 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  34.43 
 
 
1375 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  34.43 
 
 
1375 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1378 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1295 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1375 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1375 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1375 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.38 
 
 
1295 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1375 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  31.29 
 
 
823 aa  345  2e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1295 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 
1375 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1300 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  34.71 
 
 
1380 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1300 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1300 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  34.2 
 
 
1312 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1300 aa  343  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1306 aa  343  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1306 aa  343  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  33.14 
 
 
1281 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1306 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.25 
 
 
1303 aa  342  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.02 
 
 
1312 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.94 
 
 
1345 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.43 
 
 
1306 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.58 
 
 
1300 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  33.86 
 
 
1339 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  35.19 
 
 
1367 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  34.78 
 
 
1311 aa  340  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.14 
 
 
1300 aa  340  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  33.67 
 
 
1339 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.19 
 
 
1300 aa  340  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  33.14 
 
 
1300 aa  340  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.14 
 
 
1300 aa  340  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  33 
 
 
1297 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 
1329 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.14 
 
 
1295 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  33.38 
 
 
1294 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.64 
 
 
1328 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  32.01 
 
 
1305 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  32.91 
 
 
1329 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 
1402 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  34.63 
 
 
1402 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 
1403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  32.2 
 
 
1291 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  34.77 
 
 
1314 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  33.47 
 
 
1291 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>