More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02430 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  49.92 
 
 		 1128 aa  663    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  65.6 
 
 		 924 aa  1161    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  48.36 
 
 		 1241 aa  761    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  48.98 
 
 		 1075 aa  660    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  47.37 
 
 		 1189 aa  757    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 		 1261 aa  2618    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  49 
 
 		 1012 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  49.22 
 
 		 873 aa  668    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  47.51 
 
 		 1135 aa  763    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  56.39 
 
 		 989 aa  1109    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  45.09 
 
 		 769 aa  615  9.999999999999999e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  46.17 
 
 		 697 aa  606  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  47.62 
 
 		 783 aa  599  1e-170  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  46.83 
 
 		 771 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  42.35 
 
 		 720 aa  566  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.79 
 
 		 679 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  41.72 
 
 		 699 aa  522  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  43.04 
 
 		 724 aa  509  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  41.98 
 
 		 670 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  38.77 
 
 		 713 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  35.7 
 
 		 824 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  39.4 
 
 		 665 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  37.89 
 
 		 1294 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  37.37 
 
 		 830 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  51.55 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  36.68 
 
 		 1281 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  37.88 
 
 		 1312 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  36.25 
 
 		 1324 aa  406  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  36.2 
 
 		 1275 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  37.04 
 
 		 651 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 		 1305 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  36.18 
 
 		 1312 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  37.8 
 
 		 1303 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  35.65 
 
 		 1329 aa  400  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  37.91 
 
 		 1298 aa  399  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  33.94 
 
 		 814 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  36.45 
 
 		 1324 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  35.9 
 
 		 1290 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  35.54 
 
 		 1307 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.32 
 
 		 1290 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 		 1328 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  37.38 
 
 		 1303 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  38.03 
 
 		 1360 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  36.86 
 
 		 1282 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.97 
 
 		 1303 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  35.86 
 
 		 1311 aa  390  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  38.1 
 
 		 1317 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  37.17 
 
 		 1303 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  36.55 
 
 		 1326 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  35.56 
 
 		 1312 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  36.42 
 
 		 1293 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  36.42 
 
 		 1293 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  36.76 
 
 		 1326 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.85 
 
 		 1345 aa  390  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  36.27 
 
 		 1293 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  35.8 
 
 		 1296 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  36.07 
 
 		 1293 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  34 
 
 		 1307 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  36.57 
 
 		 1293 aa  386  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  36.38 
 
 		 1293 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  37.17 
 
 		 1303 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  35.97 
 
 		 1318 aa  386  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  36.46 
 
 		 1318 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  36.01 
 
 		 1316 aa  387  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  36.22 
 
 		 1291 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  36.38 
 
 		 1293 aa  387  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  36.41 
 
 		 1289 aa  386  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  37.27 
 
 		 1315 aa  383  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  36.38 
 
 		 1293 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  38.62 
 
 		 1301 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  35.48 
 
 		 1329 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  35.46 
 
 		 1308 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  37 
 
 		 1291 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.2 
 
 		 1309 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 		 1341 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  36.23 
 
 		 1349 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  39.82 
 
 		 1310 aa  383  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  36.88 
 
 		 1310 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.33 
 
 		 1295 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.33 
 
 		 1295 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.17 
 
 		 1298 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  36.15 
 
 		 1291 aa  380  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  40.04 
 
 		 1374 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.55 
 
 		 1295 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 		 1301 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  35.91 
 
 		 1316 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  39.59 
 
 		 1373 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  35.79 
 
 		 1307 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.23 
 
 		 1295 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  36.51 
 
 		 1291 aa  376  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  35.66 
 
 		 1300 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 		 1301 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  34.36 
 
 		 870 aa  372  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  34.82 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.66 
 
 		 1300 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.32 
 
 		 1300 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.9 
 
 		 1295 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.66 
 
 		 1300 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.66 
 
 		 1300 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  34.22 
 
 		 1282 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>