More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87921 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  49.92 
 
 
1128 aa  640    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  73.67 
 
 
769 aa  1082    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  57.54 
 
 
720 aa  796    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  64.12 
 
 
783 aa  907    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  63.62 
 
 
697 aa  868    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  100 
 
 
771 aa  1600    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  51.78 
 
 
1135 aa  670    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  50.31 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  50.15 
 
 
1012 aa  629  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  45.84 
 
 
1189 aa  625  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  50.16 
 
 
873 aa  621  1e-176  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  47.71 
 
 
1075 aa  611  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  44.95 
 
 
1261 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  45.17 
 
 
924 aa  596  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  43.93 
 
 
989 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  44.51 
 
 
699 aa  537  1e-151  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.16 
 
 
679 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  43.33 
 
 
670 aa  515  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  42.69 
 
 
713 aa  498  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  41.89 
 
 
724 aa  492  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  39.29 
 
 
830 aa  462  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  41.82 
 
 
665 aa  440  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  37.48 
 
 
1290 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  37.9 
 
 
1326 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  37.18 
 
 
1282 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.35 
 
 
1303 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  38.05 
 
 
1326 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  38.32 
 
 
1294 aa  426  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  36.35 
 
 
1307 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  36.8 
 
 
1303 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  37.27 
 
 
1290 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  36.8 
 
 
1303 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  37.1 
 
 
1303 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.91 
 
 
1309 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  36.84 
 
 
1298 aa  422  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  38.59 
 
 
1310 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35.3 
 
 
1328 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  37.09 
 
 
1338 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 
1291 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 
1293 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.01 
 
 
1298 aa  418  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  37.63 
 
 
1293 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  38.18 
 
 
1312 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  36.27 
 
 
824 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  36.61 
 
 
1318 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  37.03 
 
 
1293 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  36.76 
 
 
1324 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.3 
 
 
1345 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  36.28 
 
 
1306 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  36.91 
 
 
1317 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  36.56 
 
 
651 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.59 
 
 
1295 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  35.61 
 
 
1308 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  36.96 
 
 
1310 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  37.39 
 
 
1311 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  36.96 
 
 
1291 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  36.63 
 
 
1312 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  37.18 
 
 
1293 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.29 
 
 
1295 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  36.34 
 
 
1293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  36.28 
 
 
1307 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  36.34 
 
 
1293 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  36.6 
 
 
1289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.73 
 
 
1295 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  36.18 
 
 
1293 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  35.96 
 
 
1318 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  36.03 
 
 
1293 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.98 
 
 
1295 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 
1303 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.74 
 
 
1295 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  35.49 
 
 
1281 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  35.34 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  36.95 
 
 
1301 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  36.95 
 
 
1301 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.86 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.09 
 
 
1306 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.09 
 
 
1306 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.09 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  36.23 
 
 
1275 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.09 
 
 
1306 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  36.6 
 
 
1281 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  37.22 
 
 
1301 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  36.17 
 
 
1315 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.09 
 
 
1306 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  36.96 
 
 
1325 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.69 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.74 
 
 
1295 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.34 
 
 
1300 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.86 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.34 
 
 
1300 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  41.29 
 
 
1374 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.34 
 
 
1300 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  36.72 
 
 
1295 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  37.1 
 
 
1301 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  35.02 
 
 
1296 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  36.19 
 
 
1339 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  35.42 
 
 
1316 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.56 
 
 
1339 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  36.25 
 
 
1291 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  36.63 
 
 
1295 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>