More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01640 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  51.44 
 
 
670 aa  677    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 
699 aa  1457    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  49.92 
 
 
1241 aa  630  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  50.15 
 
 
1135 aa  627  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  47.63 
 
 
873 aa  607  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  45.08 
 
 
713 aa  605  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  47.85 
 
 
1189 aa  597  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  45.78 
 
 
1128 aa  587  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  44.19 
 
 
1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  45.85 
 
 
1012 aa  563  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  46.01 
 
 
720 aa  561  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  44.58 
 
 
697 aa  557  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  44.22 
 
 
783 aa  543  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  42.05 
 
 
989 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.68 
 
 
679 aa  540  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  44.18 
 
 
769 aa  537  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  44.36 
 
 
771 aa  531  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  43.29 
 
 
924 aa  528  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  41.72 
 
 
1261 aa  522  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  42.19 
 
 
651 aa  479  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  37.97 
 
 
830 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  35.86 
 
 
824 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  38.81 
 
 
724 aa  442  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  38.77 
 
 
665 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.96 
 
 
1303 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  35.69 
 
 
1307 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  37.95 
 
 
1315 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  36.28 
 
 
1318 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  35.56 
 
 
1303 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  36.05 
 
 
1303 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  34.87 
 
 
1342 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  36.21 
 
 
1298 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  35.67 
 
 
1296 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 
1303 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  34.11 
 
 
814 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  36.57 
 
 
1281 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  35.59 
 
 
1310 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  35.15 
 
 
1303 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.85 
 
 
1290 aa  363  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  34.94 
 
 
1316 aa  360  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  35.15 
 
 
1329 aa  359  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  34.46 
 
 
1275 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  35.17 
 
 
1305 aa  359  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  35.99 
 
 
1312 aa  359  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.44 
 
 
1309 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  34.93 
 
 
1326 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 
1326 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35 
 
 
1328 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.42 
 
 
1282 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.19 
 
 
1345 aa  356  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.6 
 
 
1306 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.33 
 
 
1295 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.6 
 
 
1306 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.45 
 
 
1306 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.5 
 
 
1295 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.6 
 
 
1300 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  34.09 
 
 
1338 aa  354  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.45 
 
 
1306 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1295 aa  353  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.28 
 
 
1324 aa  353  8e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.28 
 
 
1295 aa  353  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  34.25 
 
 
1300 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.35 
 
 
1300 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.25 
 
 
1300 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.35 
 
 
1300 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.69 
 
 
1295 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.35 
 
 
1300 aa  352  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.35 
 
 
1300 aa  352  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  34.72 
 
 
1317 aa  352  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.89 
 
 
1298 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.25 
 
 
1300 aa  351  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  34.14 
 
 
1293 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  33.59 
 
 
1290 aa  351  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  33.49 
 
 
823 aa  350  5e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  34.19 
 
 
1281 aa  350  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  34.14 
 
 
1293 aa  350  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.23 
 
 
1339 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  35.35 
 
 
1331 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  33.83 
 
 
1293 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  33.98 
 
 
1293 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  34.78 
 
 
1323 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  34.19 
 
 
1312 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  32.86 
 
 
1353 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.54 
 
 
1295 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.12 
 
 
1295 aa  346  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.24 
 
 
1294 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  34.09 
 
 
1293 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  46.33 
 
 
422 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  34.79 
 
 
1318 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  33.63 
 
 
1289 aa  346  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  35.48 
 
 
1289 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  35.05 
 
 
1310 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  33.94 
 
 
1293 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  34.74 
 
 
1333 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  34.25 
 
 
1295 aa  343  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.74 
 
 
1300 aa  343  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  34.37 
 
 
1301 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  34.93 
 
 
1339 aa  343  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  33.94 
 
 
1291 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 
1291 aa  342  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>