More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05350 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  100 
 
 
1325 aa  2729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  41.82 
 
 
1288 aa  581  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  41.15 
 
 
811 aa  551  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  38.54 
 
 
936 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  29.03 
 
 
1407 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  36.97 
 
 
790 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  34.91 
 
 
1041 aa  467  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  32.19 
 
 
1436 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  41.02 
 
 
1545 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.41 
 
 
1469 aa  374  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 
1450 aa  342  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  39.33 
 
 
528 aa  333  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
1581 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  32.64 
 
 
697 aa  314  9e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  31.22 
 
 
1135 aa  302  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  31.7 
 
 
1189 aa  301  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  31.69 
 
 
771 aa  301  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  31.82 
 
 
924 aa  299  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  30.89 
 
 
1128 aa  298  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  33.81 
 
 
1241 aa  298  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  33.88 
 
 
1324 aa  297  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  34.91 
 
 
1075 aa  296  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  31.18 
 
 
1012 aa  296  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  31.86 
 
 
1261 aa  295  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  31.33 
 
 
873 aa  295  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  32.09 
 
 
1326 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  32.8 
 
 
1281 aa  294  8e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  31.67 
 
 
1326 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  31.28 
 
 
769 aa  293  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  33.89 
 
 
1303 aa  293  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  31.3 
 
 
1338 aa  291  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.07 
 
 
1294 aa  290  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  33.07 
 
 
720 aa  289  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  32.89 
 
 
1310 aa  289  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  30.99 
 
 
1342 aa  288  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  31.83 
 
 
1305 aa  288  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  30.44 
 
 
1290 aa  288  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  32.28 
 
 
1275 aa  288  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  31.81 
 
 
1329 aa  288  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.72 
 
 
1295 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  29.78 
 
 
1309 aa  285  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 
1315 aa  284  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.17 
 
 
1328 aa  284  9e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  33.94 
 
 
1318 aa  284  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  30.52 
 
 
989 aa  283  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.35 
 
 
1303 aa  283  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  33.11 
 
 
1295 aa  283  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  34.9 
 
 
1374 aa  282  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  34.54 
 
 
1303 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  34.37 
 
 
1303 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  34.33 
 
 
1307 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  34.48 
 
 
1303 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.84 
 
 
1298 aa  280  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 
1310 aa  279  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.5 
 
 
1295 aa  279  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  32.81 
 
 
1355 aa  278  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 
1333 aa  278  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  32.8 
 
 
1312 aa  278  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  33.17 
 
 
1331 aa  277  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 
1293 aa  277  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 
1323 aa  277  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  32.23 
 
 
1320 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  30.56 
 
 
1308 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 
1293 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 
1291 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  30.52 
 
 
1296 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  32.23 
 
 
1428 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 
1310 aa  276  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  32.78 
 
 
1293 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.51 
 
 
1300 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  34.38 
 
 
1331 aa  276  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.06 
 
 
1295 aa  276  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.51 
 
 
1345 aa  275  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  32.33 
 
 
1298 aa  275  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.06 
 
 
1295 aa  276  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  30.55 
 
 
1282 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  275  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  31.34 
 
 
1281 aa  275  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  275  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  28.65 
 
 
1307 aa  274  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  274  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  274  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  32.79 
 
 
1316 aa  274  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.34 
 
 
1300 aa  274  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  31.96 
 
 
1291 aa  274  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.56 
 
 
1295 aa  274  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.44 
 
 
1309 aa  274  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 
1293 aa  273  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  30.35 
 
 
783 aa  273  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  32.34 
 
 
1324 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  32.78 
 
 
1293 aa  273  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.56 
 
 
1295 aa  273  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.18 
 
 
1306 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 
1293 aa  273  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.18 
 
 
1300 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.18 
 
 
1306 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.18 
 
 
1306 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.18 
 
 
1306 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  33.39 
 
 
1317 aa  271  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>