More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34459 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  100 
 
 		 936 aa  1926    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  44.31 
 
 		 811 aa  676    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  39.12 
 
 		 1041 aa  586  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  38.61 
 
 		 790 aa  514  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  38.88 
 
 		 1288 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  38.89 
 
 		 1325 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  34 
 
 		 1436 aa  459  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  32.66 
 
 		 1407 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  39.32 
 
 		 1545 aa  425  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  34.76 
 
 		 1450 aa  414  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  34.29 
 
 		 1469 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  36.94 
 
 		 1581 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  41.24 
 
 		 528 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  33.29 
 
 		 697 aa  343  9e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  32.76 
 
 		 783 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  32.01 
 
 		 771 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  32.66 
 
 		 699 aa  320  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  31.72 
 
 		 1329 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  29.88 
 
 		 1012 aa  315  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  29.36 
 
 		 989 aa  313  9e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1312 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  33.96 
 
 		 720 aa  311  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  31.03 
 
 		 1342 aa  307  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  30.91 
 
 		 1338 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  35.53 
 
 		 1310 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  33.06 
 
 		 670 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  34.46 
 
 		 1315 aa  303  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  32.14 
 
 		 713 aa  302  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  30.96 
 
 		 1326 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  30.87 
 
 		 1326 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  30.1 
 
 		 1241 aa  300  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  29.87 
 
 		 924 aa  300  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.18 
 
 		 1281 aa  298  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  33.81 
 
 		 1316 aa  298  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  30.39 
 
 		 1374 aa  298  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  33.16 
 
 		 998 aa  297  8e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  31.54 
 
 		 1290 aa  297  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.86 
 
 		 1298 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  33.86 
 
 		 1303 aa  296  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  31.28 
 
 		 1324 aa  294  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.96 
 
 		 1345 aa  294  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.64 
 
 		 1328 aa  294  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  30.36 
 
 		 1296 aa  293  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  33.6 
 
 		 1376 aa  293  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  32.74 
 
 		 1309 aa  293  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  31.73 
 
 		 1282 aa  293  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  31.26 
 
 		 1435 aa  292  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  32.51 
 
 		 1303 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  33.76 
 
 		 1320 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  35.05 
 
 		 1312 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  32.58 
 
 		 1324 aa  291  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  32.51 
 
 		 1303 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  31.35 
 
 		 1316 aa  290  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  34.24 
 
 		 1462 aa  290  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  31.76 
 
 		 1275 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  32.85 
 
 		 1310 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  33.12 
 
 		 1378 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.65 
 
 		 1329 aa  288  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  33.39 
 
 		 1331 aa  288  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  34.35 
 
 		 1306 aa  287  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1402 aa  287  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  33.12 
 
 		 1326 aa  287  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1402 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.43 
 
 		 1309 aa  286  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  30.03 
 
 		 1291 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  31.14 
 
 		 1318 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1314 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1403 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2176  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1306 aa  285  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440944  normal  0.199905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  29.94 
 
 		 1560 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  31.25 
 
 		 1411 aa  284  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  34.05 
 
 		 1307 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  33.01 
 
 		 1380 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  29.89 
 
 		 1307 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  30.7 
 
 		 1323 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  33.07 
 
 		 1428 aa  282  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 		 1298 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  30.2 
 
 		 1295 aa  281  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.58 
 
 		 1295 aa  280  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  30 
 
 		 1301 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1375 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  33.08 
 
 		 1355 aa  280  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  29.57 
 
 		 1423 aa  279  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  31.64 
 
 		 1301 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  33.6 
 
 		 1378 aa  278  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  31.9 
 
 		 1331 aa  278  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  30.28 
 
 		 1289 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  30.09 
 
 		 1312 aa  278  4e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  34.36 
 
 		 1391 aa  277  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  32.24 
 
 		 1478 aa  276  9e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  34.4 
 
 		 1402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  33.17 
 
 		 1349 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  29.27 
 
 		 1308 aa  275  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  30.75 
 
 		 1301 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>