More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_193 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  100 
 
 		 811 aa  1662    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  44.26 
 
 		 936 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  41.85 
 
 		 1041 aa  568  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  39.49 
 
 		 790 aa  524  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  41.22 
 
 		 1325 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  37.78 
 
 		 1288 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  34.56 
 
 		 1436 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  41.8 
 
 		 1545 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  31.36 
 
 		 1407 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  38.66 
 
 		 1581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  34.02 
 
 		 1450 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  39.78 
 
 		 528 aa  366  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  34.57 
 
 		 1469 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  30.58 
 
 		 699 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  30.48 
 
 		 783 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  35.04 
 
 		 998 aa  302  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  29.25 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  33.44 
 
 		 1462 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  32.9 
 
 		 1380 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.61 
 
 		 1375 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.61 
 
 		 1375 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.61 
 
 		 1375 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.61 
 
 		 1375 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  32.85 
 
 		 1428 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  32.9 
 
 		 1375 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  32.9 
 
 		 1375 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  31.48 
 
 		 1275 aa  277  7e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  32.9 
 
 		 1375 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 		 1329 aa  276  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  32.68 
 
 		 1320 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  31.1 
 
 		 1326 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  31.79 
 
 		 670 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  32.74 
 
 		 1403 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  32.57 
 
 		 1378 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  31.1 
 
 		 1326 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  32.63 
 
 		 1402 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  31.49 
 
 		 1303 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  33.73 
 
 		 1402 aa  273  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  30.34 
 
 		 1324 aa  273  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 		 1316 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  31.48 
 
 		 1303 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  32.3 
 
 		 1402 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  32.41 
 
 		 1314 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  32.99 
 
 		 1353 aa  271  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  32.73 
 
 		 1298 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  31.34 
 
 		 1303 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  32.27 
 
 		 1373 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  32.07 
 
 		 1361 aa  269  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  33.55 
 
 		 1374 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  32.8 
 
 		 1478 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  30.62 
 
 		 1305 aa  267  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  30.72 
 
 		 1301 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  32.38 
 
 		 1466 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  30.58 
 
 		 1301 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  32.81 
 
 		 1378 aa  263  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  31.01 
 
 		 1435 aa  263  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  29.47 
 
 		 1331 aa  263  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  31.64 
 
 		 1330 aa  262  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  30.72 
 
 		 1301 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  30.93 
 
 		 1315 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  34.21 
 
 		 1355 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  33.22 
 
 		 1301 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  32.03 
 
 		 1349 aa  255  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  31.39 
 
 		 1324 aa  251  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  29.61 
 
 		 1326 aa  250  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  32.04 
 
 		 1309 aa  247  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  33.03 
 
 		 1310 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  34.87 
 
 		 1135 aa  243  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  32.46 
 
 		 1222 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  34.27 
 
 		 1128 aa  235  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  30.06 
 
 		 1438 aa  233  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  33.74 
 
 		 422 aa  232  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  28.05 
 
 		 824 aa  231  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  33.95 
 
 		 1241 aa  230  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 1295 aa  230  9e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  35.21 
 
 		 844 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0877  ATP-dependent helicase HrpA  32.23 
 
 		 1363 aa  228  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0749842  normal  0.69744 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  34.7 
 
 		 1075 aa  227  6e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  32.34 
 
 		 1566 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  32.73 
 
 		 989 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  29.38 
 
 		 1411 aa  224  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  32.23 
 
 		 821 aa  224  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  31.67 
 
 		 924 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  28.95 
 
 		 1317 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  33.49 
 
 		 1189 aa  220  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  29.38 
 
 		 1310 aa  217  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  33.94 
 
 		 697 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  34.44 
 
 		 891 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  28.97 
 
 		 1300 aa  210  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.97 
 
 		 1300 aa  210  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.97 
 
 		 1300 aa  210  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.93 
 
 		 1300 aa  210  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.93 
 
 		 1300 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44062  predicted protein  29.49 
 
 		 1943 aa  208  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  32.47 
 
 		 900 aa  207  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  31 
 
 		 1261 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  32.81 
 
 		 821 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  33.07 
 
 		 1624 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  31.78 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  32.58 
 
 		 720 aa  202  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>