More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44062 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44062  predicted protein  100 
 
 		 1943 aa  4047    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284084  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  29.39 
 
 		 1436 aa  243  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  29.22 
 
 		 811 aa  222  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  31.72 
 
 		 1325 aa  220  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  30.26 
 
 		 1407 aa  216  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  29.83 
 
 		 790 aa  217  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  31.83 
 
 		 528 aa  211  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  26.48 
 
 		 873 aa  206  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  28.08 
 
 		 1075 aa  200  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  28.28 
 
 		 720 aa  199  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  27.98 
 
 		 697 aa  199  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  29.46 
 
 		 1128 aa  198  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  26.99 
 
 		 783 aa  198  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  30.31 
 
 		 1288 aa  195  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  27.71 
 
 		 1012 aa  194  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 		 1581 aa  194  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  27.63 
 
 		 1189 aa  188  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  28.02 
 
 		 1241 aa  186  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  30.41 
 
 		 724 aa  186  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  27.41 
 
 		 769 aa  183  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  27.49 
 
 		 989 aa  183  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  29.25 
 
 		 1041 aa  181  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  27.24 
 
 		 670 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  25.49 
 
 		 1261 aa  178  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  28.43 
 
 		 924 aa  177  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.33 
 
 		 1469 aa  177  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  25.83 
 
 		 771 aa  176  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  25.76 
 
 		 713 aa  172  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  27.87 
 
 		 830 aa  172  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  26.6 
 
 		 1378 aa  171  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  26.39 
 
 		 1282 aa  170  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  27.6 
 
 		 1342 aa  169  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 1450 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  25.65 
 
 		 1135 aa  168  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  28.08 
 
 		 1361 aa  168  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  28.57 
 
 		 511 aa  166  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  29.82 
 
 		 1309 aa  166  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  25.2 
 
 		 699 aa  165  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  27.53 
 
 		 1310 aa  163  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  29.57 
 
 		 870 aa  162  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  29.18 
 
 		 1293 aa  161  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  27.54 
 
 		 1317 aa  161  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  29.18 
 
 		 1293 aa  161  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  28.77 
 
 		 1293 aa  160  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  29.22 
 
 		 1394 aa  160  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  27.91 
 
 		 1374 aa  160  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  27.43 
 
 		 1326 aa  160  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  29.09 
 
 		 1293 aa  160  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0585  ATP-dependent helicase HrpB  29.46 
 
 		 835 aa  160  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  29.09 
 
 		 1293 aa  160  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  28.89 
 
 		 1293 aa  160  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  29.18 
 
 		 1293 aa  159  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  27.82 
 
 		 1312 aa  159  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  27.62 
 
 		 1326 aa  159  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  28.89 
 
 		 1291 aa  159  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  26.87 
 
 		 651 aa  159  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1767  ATP-dependent helicase HrpA  28.28 
 
 		 1295 aa  157  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  28.51 
 
 		 1338 aa  157  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  25.74 
 
 		 823 aa  157  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  25.82 
 
 		 1297 aa  157  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  28.89 
 
 		 1293 aa  157  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  26.81 
 
 		 1367 aa  156  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  28.23 
 
 		 1281 aa  155  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  26.4 
 
 		 1291 aa  155  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  27.62 
 
 		 1294 aa  154  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07030  ATP-dependent RNA helicase prh1, putative  27.3 
 
 		 814 aa  154  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  26.32 
 
 		 1326 aa  154  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  27.85 
 
 		 679 aa  154  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  26.26 
 
 		 1560 aa  153  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  27.45 
 
 		 842 aa  152  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  24.79 
 
 		 1282 aa  152  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  26.05 
 
 		 833 aa  152  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  26.77 
 
 		 1341 aa  152  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  27.86 
 
 		 1291 aa  152  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  27.13 
 
 		 1308 aa  152  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  27.6 
 
 		 1303 aa  152  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  27.11 
 
 		 1303 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  26.92 
 
 		 1325 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  29.19 
 
 		 665 aa  151  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  26.87 
 
 		 1295 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  26.24 
 
 		 1329 aa  150  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  27.73 
 
 		 1336 aa  149  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  28.64 
 
 		 1275 aa  149  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  27.94 
 
 		 828 aa  149  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  26.4 
 
 		 1324 aa  148  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  26.65 
 
 		 1303 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  26.85 
 
 		 1355 aa  148  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  24.74 
 
 		 1438 aa  148  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  25.84 
 
 		 833 aa  148  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  31.1 
 
 		 1330 aa  147  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  27.83 
 
 		 1624 aa  147  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  25.4 
 
 		 1423 aa  147  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  27.23 
 
 		 1305 aa  147  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  25.55 
 
 		 1318 aa  147  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  30.71 
 
 		 1566 aa  147  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  27.62 
 
 		 1428 aa  147  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  27.36 
 
 		 1291 aa  147  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  27.77 
 
 		 1402 aa  147  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  28.09 
 
 		 1296 aa  147  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  27.42 
 
 		 1320 aa  147  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>