More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_708 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  100 
 
 
511 aa  1048    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  39.08 
 
 
720 aa  313  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  38.43 
 
 
1135 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  37.86 
 
 
924 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  37.8 
 
 
1241 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  37.94 
 
 
1261 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  37.48 
 
 
989 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  38.09 
 
 
697 aa  302  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  36.35 
 
 
679 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  38.28 
 
 
1294 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  39.05 
 
 
1189 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  37.6 
 
 
1075 aa  299  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  37.38 
 
 
824 aa  299  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  36.2 
 
 
873 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  36.13 
 
 
1012 aa  289  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  34.87 
 
 
1128 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  40 
 
 
724 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.59 
 
 
1312 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  36.55 
 
 
783 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.18 
 
 
1303 aa  281  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  37.8 
 
 
1298 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  37.05 
 
 
1312 aa  280  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  36.12 
 
 
1281 aa  279  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  36.93 
 
 
1338 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 
1303 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 
1303 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 
1329 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  36.15 
 
 
1297 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  36.74 
 
 
1310 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  52.45 
 
 
1270 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  36.78 
 
 
1315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  37.71 
 
 
1326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  36.04 
 
 
1281 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.04 
 
 
1300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  36.12 
 
 
1342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.04 
 
 
1300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  37.02 
 
 
1374 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.04 
 
 
1300 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.04 
 
 
1300 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  35.71 
 
 
1316 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  36.43 
 
 
1282 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  36.54 
 
 
1296 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  36.84 
 
 
1333 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  35.77 
 
 
1316 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  36.19 
 
 
1311 aa  273  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.11 
 
 
1300 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.11 
 
 
1300 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  36.11 
 
 
1300 aa  272  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  36.65 
 
 
1310 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.44 
 
 
1306 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  35.7 
 
 
1296 aa  272  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  35.14 
 
 
1330 aa  272  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 
1324 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  35.52 
 
 
1341 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.24 
 
 
1306 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  35.71 
 
 
1303 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  34.99 
 
 
1336 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  37.7 
 
 
665 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.24 
 
 
1300 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.24 
 
 
1306 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.24 
 
 
1306 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.67 
 
 
1290 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  35.97 
 
 
1367 aa  271  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  35.26 
 
 
1323 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  37.33 
 
 
1326 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  36.12 
 
 
1290 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  35.79 
 
 
1328 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  35.42 
 
 
769 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.5 
 
 
1309 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.59 
 
 
1345 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  51.24 
 
 
1153 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  37.15 
 
 
1318 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  36.38 
 
 
1324 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  35.66 
 
 
1351 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  36.1 
 
 
771 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  35.45 
 
 
1289 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  35.91 
 
 
1282 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  35.41 
 
 
1326 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.43 
 
 
1295 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.63 
 
 
1295 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  34.58 
 
 
1305 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.45 
 
 
1295 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.45 
 
 
1295 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  36.36 
 
 
1341 aa  266  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2595  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.63 
 
 
1295 aa  266  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0877  ATP-dependent helicase HrpA  36.2 
 
 
1363 aa  266  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0749842  normal  0.69744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  34.92 
 
 
1375 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  36.17 
 
 
1341 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  35.26 
 
 
1318 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  35.16 
 
 
1339 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  35.81 
 
 
1339 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  36.42 
 
 
1303 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 
1375 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1320 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 
1380 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  35.27 
 
 
1375 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  35.33 
 
 
1428 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  35.12 
 
 
1291 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  35.56 
 
 
699 aa  264  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  35.25 
 
 
1300 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>