More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38526 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  100 
 
 
1153 aa  2352    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  42.81 
 
 
1295 aa  591  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  47.03 
 
 
956 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  30.49 
 
 
769 aa  311  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  31.43 
 
 
1326 aa  305  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  30.95 
 
 
1375 aa  299  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  31.2 
 
 
1375 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  31.2 
 
 
1375 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  31.2 
 
 
1375 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  36.61 
 
 
1270 aa  288  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  29.87 
 
 
1435 aa  272  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  29.3 
 
 
1361 aa  272  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  29.31 
 
 
1378 aa  270  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  30.87 
 
 
1041 aa  269  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  51.24 
 
 
511 aa  267  7e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  33.83 
 
 
1624 aa  238  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  30.54 
 
 
936 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  32.67 
 
 
1135 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  35.13 
 
 
1312 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  32.5 
 
 
697 aa  218  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  32.43 
 
 
422 aa  218  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  31.09 
 
 
1261 aa  214  9e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  43.75 
 
 
720 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  43.48 
 
 
924 aa  207  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  32.37 
 
 
783 aa  207  9e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  31.53 
 
 
1189 aa  207  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  30.54 
 
 
1241 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  31.38 
 
 
989 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  41.03 
 
 
1128 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  42.16 
 
 
1075 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  41.7 
 
 
873 aa  197  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  32.27 
 
 
1294 aa  194  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  33.87 
 
 
1324 aa  194  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  40.22 
 
 
1012 aa  194  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  32.77 
 
 
1298 aa  193  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  35.21 
 
 
1307 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  28.66 
 
 
679 aa  191  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  31.92 
 
 
1441 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  34.27 
 
 
1291 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  34.66 
 
 
1318 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  43.65 
 
 
724 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  34.27 
 
 
1293 aa  188  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  34.59 
 
 
1315 aa  188  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  34.27 
 
 
1293 aa  188  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  34.28 
 
 
1326 aa  188  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  33.95 
 
 
1303 aa  188  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0228  ATP-dependent helicase HrpA  34.32 
 
 
1471 aa  187  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.406446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  32.92 
 
 
1341 aa  187  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  33.95 
 
 
1317 aa  187  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  34.28 
 
 
1326 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  30.1 
 
 
1296 aa  187  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  34.03 
 
 
1311 aa  186  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  32.83 
 
 
1312 aa  186  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  31.05 
 
 
1376 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  33.8 
 
 
1293 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  41.37 
 
 
824 aa  184  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  31.84 
 
 
1310 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  40.45 
 
 
699 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1815  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.14 
 
 
1295 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.774398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1925  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.14 
 
 
1295 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  33.57 
 
 
1339 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  32.95 
 
 
1324 aa  182  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  31.5 
 
 
1282 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  39.21 
 
 
771 aa  181  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.83 
 
 
1306 aa  181  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  31.66 
 
 
1423 aa  181  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  33.26 
 
 
1339 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  33.57 
 
 
1293 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  38.38 
 
 
1312 aa  180  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  31.75 
 
 
1281 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  180  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  180  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.97 
 
 
1306 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.6 
 
 
1281 aa  180  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.97 
 
 
1306 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.97 
 
 
1306 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1300 aa  180  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.64 
 
 
1309 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.97 
 
 
1300 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.98 
 
 
1298 aa  179  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  38.55 
 
 
1316 aa  179  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  30.96 
 
 
1560 aa  178  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  29.6 
 
 
1282 aa  179  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  29.6 
 
 
1328 aa  178  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  38.51 
 
 
1310 aa  178  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.75 
 
 
1306 aa  178  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.11 
 
 
1290 aa  178  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.03 
 
 
1295 aa  178  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  30.89 
 
 
1293 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.52 
 
 
1300 aa  177  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  30.49 
 
 
1293 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  30.56 
 
 
1338 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30 
 
 
1295 aa  177  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  29.9 
 
 
1296 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  41.6 
 
 
713 aa  177  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  29.2 
 
 
1345 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  31.52 
 
 
1331 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>