More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40777 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  100 
 
 		 1041 aa  2135    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  41.41 
 
 		 811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  38.76 
 
 		 936 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  38.83 
 
 		 790 aa  524  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  35.93 
 
 		 1545 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  34.98 
 
 		 1325 aa  445  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  33.71 
 
 		 1436 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  34.69 
 
 		 1288 aa  422  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  32.41 
 
 		 998 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  30.91 
 
 		 1407 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  37.2 
 
 		 1581 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 1450 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  36.47 
 
 		 528 aa  321  5e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.84 
 
 		 1469 aa  302  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  30.5 
 
 		 1270 aa  297  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  30.01 
 
 		 1295 aa  283  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  31.65 
 
 		 956 aa  261  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  30.19 
 
 		 1478 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  30.23 
 
 		 1466 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  29.53 
 
 		 1428 aa  247  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  32.2 
 
 		 1355 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  29.4 
 
 		 1320 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  31.08 
 
 		 1316 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.62 
 
 		 1375 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.62 
 
 		 1375 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.62 
 
 		 1375 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.62 
 
 		 1375 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  34.08 
 
 		 1402 aa  239  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  33.16 
 
 		 1462 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  32.93 
 
 		 1402 aa  237  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  32.93 
 
 		 1402 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  28.72 
 
 		 1566 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  32.93 
 
 		 1314 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  32.76 
 
 		 1403 aa  235  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  33.04 
 
 		 1298 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  28.18 
 
 		 1353 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1309 aa  226  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  30.33 
 
 		 1310 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  30.45 
 
 		 1349 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_41756  predicted protein  29.02 
 
 		 651 aa  208  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  29.23 
 
 		 1378 aa  204  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  28.04 
 
 		 1361 aa  203  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  27.2 
 
 		 1435 aa  203  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  31.25 
 
 		 1331 aa  196  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  31.4 
 
 		 422 aa  196  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  29.65 
 
 		 1135 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  31.44 
 
 		 1222 aa  190  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  31.21 
 
 		 713 aa  181  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44062  predicted protein  29.25 
 
 		 1943 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284084  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  29.49 
 
 		 1241 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  29.92 
 
 		 1189 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  29.41 
 
 		 783 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  27.95 
 
 		 924 aa  172  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  29.76 
 
 		 697 aa  171  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3895  ATP-dependent helicase HrpB  29.25 
 
 		 855 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  29.37 
 
 		 670 aa  168  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  29.85 
 
 		 720 aa  167  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  29.07 
 
 		 1012 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  26.91 
 
 		 1075 aa  166  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  29.91 
 
 		 1342 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  30.14 
 
 		 699 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  40.57 
 
 		 679 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  28.98 
 
 		 873 aa  164  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  28.85 
 
 		 989 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  27.63 
 
 		 1261 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  30.38 
 
 		 870 aa  160  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  28.54 
 
 		 1128 aa  160  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  30.74 
 
 		 1294 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  29.12 
 
 		 771 aa  160  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  29.01 
 
 		 724 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  30.43 
 
 		 1307 aa  155  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  34.06 
 
 		 1231 aa  154  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  28.54 
 
 		 1329 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  29.23 
 
 		 1316 aa  153  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  31.03 
 
 		 1326 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  31 
 
 		 1153 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  38.33 
 
 		 1310 aa  152  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  30.69 
 
 		 1326 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  30.46 
 
 		 1323 aa  152  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  32.78 
 
 		 1305 aa  152  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  31.43 
 
 		 1324 aa  151  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  32.99 
 
 		 1333 aa  151  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  39.77 
 
 		 844 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3101  ATP-dependent helicase HrpA  31.79 
 
 		 1360 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  38.31 
 
 		 824 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.23 
 
 		 1329 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41641  predicted protein  41.96 
 
 		 936 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000692526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.29 
 
 		 1290 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  28.64 
 
 		 769 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  37.63 
 
 		 1331 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  29.03 
 
 		 1281 aa  148  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.67 
 
 		 1303 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1375 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  34.96 
 
 		 1275 aa  147  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  32.77 
 
 		 1373 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1375 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1380 aa  147  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  37.28 
 
 		 1375 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  28.54 
 
 		 1282 aa  146  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  39.42 
 
 		 1306 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>