More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01980 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1581 aa  3255    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  38.43 
 
 		 811 aa  422  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  34.62 
 
 		 1288 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  37.2 
 
 		 1041 aa  392  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  35.88 
 
 		 1436 aa  374  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  37.01 
 
 		 936 aa  372  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  35.37 
 
 		 790 aa  354  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  33.54 
 
 		 1407 aa  350  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  35.92 
 
 		 1325 aa  311  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  34.4 
 
 		 528 aa  301  6e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 		 1450 aa  298  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  31.85 
 
 		 1135 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  31.8 
 
 		 783 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  29.66 
 
 		 1128 aa  286  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  32.09 
 
 		 713 aa  281  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  32.07 
 
 		 924 aa  276  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  30.54 
 
 		 1075 aa  275  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  31.57 
 
 		 1296 aa  276  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  29.48 
 
 		 1261 aa  274  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  31.07 
 
 		 1241 aa  271  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  32.78 
 
 		 1312 aa  270  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  31.81 
 
 		 720 aa  269  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  29.7 
 
 		 1189 aa  268  5e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  29.42 
 
 		 1012 aa  266  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  30.56 
 
 		 697 aa  266  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 		 1294 aa  264  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  30.3 
 
 		 769 aa  263  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  33.66 
 
 		 1339 aa  263  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  33.56 
 
 		 1281 aa  261  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  28.86 
 
 		 989 aa  261  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  34.21 
 
 		 1323 aa  261  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  33.23 
 
 		 1310 aa  261  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  33.44 
 
 		 1339 aa  260  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  34.04 
 
 		 1310 aa  260  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  33.72 
 
 		 1333 aa  260  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  29.58 
 
 		 873 aa  260  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  32.05 
 
 		 1367 aa  259  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  33.72 
 
 		 1331 aa  258  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  34.25 
 
 		 1428 aa  258  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  30.77 
 
 		 771 aa  255  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  33.22 
 
 		 1316 aa  255  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  33.01 
 
 		 1312 aa  254  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  33.05 
 
 		 1341 aa  255  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  33.65 
 
 		 1324 aa  254  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  33.23 
 
 		 1311 aa  253  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  32.49 
 
 		 1282 aa  254  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2330  ATP-dependent helicase HrpA  32.76 
 
 		 1315 aa  252  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.740295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6889  ATP-dependent RNA helicase HrpA  30.35 
 
 		 1290 aa  253  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.5003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  32.96 
 
 		 1275 aa  252  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  33.44 
 
 		 1303 aa  252  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  32.8 
 
 		 1342 aa  252  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  33.45 
 
 		 1303 aa  251  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  34.25 
 
 		 1378 aa  251  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  34.53 
 
 		 1403 aa  251  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  33.93 
 
 		 1320 aa  250  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  34.37 
 
 		 1462 aa  251  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1318 aa  250  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  32.13 
 
 		 1328 aa  249  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  32.95 
 
 		 1316 aa  248  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  33.49 
 
 		 1380 aa  248  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  31.41 
 
 		 1329 aa  248  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  32.96 
 
 		 1394 aa  248  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  34.36 
 
 		 1402 aa  248  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  32.06 
 
 		 1298 aa  247  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  34.09 
 
 		 1402 aa  247  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  30.27 
 
 		 1375 aa  246  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 		 1303 aa  246  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  246  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  30.97 
 
 		 1305 aa  246  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  28.21 
 
 		 1469 aa  245  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  245  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  245  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  34.36 
 
 		 1314 aa  244  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  244  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  244  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  244  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  32.62 
 
 		 1325 aa  244  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2366  ATP-dependent helicase HrpA  30.94 
 
 		 1336 aa  244  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000112008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1310 aa  244  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.8 
 
 		 1345 aa  244  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1375 aa  244  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28903  predicted protein  32.22 
 
 		 724 aa  243  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1303 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.41 
 
 		 1306 aa  242  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1324 aa  241  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  28.92 
 
 		 699 aa  240  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  32.97 
 
 		 1355 aa  240  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  30.77 
 
 		 1326 aa  240  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  32.36 
 
 		 1309 aa  240  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  31.97 
 
 		 1290 aa  240  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.6 
 
 		 1303 aa  239  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  33.22 
 
 		 1326 aa  239  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  32.55 
 
 		 1301 aa  239  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  33.22 
 
 		 1317 aa  238  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  34.21 
 
 		 1298 aa  238  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1654  ATP-dependent helicase HrpA, putative  29.89 
 
 		 870 aa  237  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00280546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  31.14 
 
 		 1466 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  32.48 
 
 		 1338 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  30.96 
 
 		 1307 aa  237  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  32.89 
 
 		 1326 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>