More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03560 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  34.34 
 
 		 1436 aa  711    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1450 aa  2982    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  34.2 
 
 		 936 aa  412  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  33.9 
 
 		 811 aa  387  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  33.82 
 
 		 790 aa  377  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  32 
 
 		 1041 aa  370  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  30.85 
 
 		 1288 aa  351  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  31.82 
 
 		 1325 aa  328  6e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  31.44 
 
 		 1407 aa  324  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 1581 aa  282  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  30.43 
 
 		 1326 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  31.69 
 
 		 1303 aa  260  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  29.95 
 
 		 1326 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  30.34 
 
 		 1374 aa  247  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  31.21 
 
 		 1312 aa  243  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  33.46 
 
 		 1545 aa  241  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  32.51 
 
 		 528 aa  240  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  30.25 
 
 		 1303 aa  240  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  30.72 
 
 		 1329 aa  239  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  28.22 
 
 		 1303 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  29.43 
 
 		 1281 aa  239  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  31.22 
 
 		 1275 aa  235  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  29.86 
 
 		 1310 aa  232  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  30.54 
 
 		 1301 aa  231  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  30.5 
 
 		 1355 aa  229  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  29.38 
 
 		 1324 aa  226  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  28.09 
 
 		 1469 aa  227  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01578  ATP-dependent helicase HrpA  29.89 
 
 		 1373 aa  225  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  30 
 
 		 1378 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  29.83 
 
 		 1380 aa  222  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  30.38 
 
 		 1478 aa  222  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.9 
 
 		 1295 aa  221  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  30.35 
 
 		 1462 aa  221  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  29.53 
 
 		 1316 aa  220  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  29.35 
 
 		 1308 aa  219  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  29.92 
 
 		 1466 aa  219  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  29.52 
 
 		 1301 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  29.52 
 
 		 1301 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  28.84 
 
 		 1323 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  30.47 
 
 		 1329 aa  214  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  29.17 
 
 		 1316 aa  214  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  29.42 
 
 		 1231 aa  214  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  29.83 
 
 		 1320 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  27.56 
 
 		 1435 aa  214  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  28.82 
 
 		 1402 aa  214  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  29.46 
 
 		 1428 aa  214  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  28.27 
 
 		 1309 aa  214  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  27.87 
 
 		 1290 aa  213  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  29.28 
 
 		 1375 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  29.09 
 
 		 1301 aa  213  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  29.64 
 
 		 1378 aa  212  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  28.82 
 
 		 1403 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  28.66 
 
 		 1402 aa  211  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3671  ATP-dependent helicase HrpA  29.27 
 
 		 1411 aa  211  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  25.52 
 
 		 1566 aa  211  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  28.82 
 
 		 1314 aa  208  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  28.96 
 
 		 1325 aa  208  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  27.31 
 
 		 1326 aa  206  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  30.46 
 
 		 1310 aa  207  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  28.25 
 
 		 1298 aa  206  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1811  ATP-dependent helicase HrpA  29.23 
 
 		 1311 aa  203  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  28.8 
 
 		 1349 aa  202  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  29.53 
 
 		 1317 aa  202  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  30.67 
 
 		 1402 aa  201  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36189  predicted protein  41.22 
 
 		 998 aa  200  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  27.47 
 
 		 1295 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  27.51 
 
 		 1331 aa  196  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  28.93 
 
 		 1361 aa  196  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  27.62 
 
 		 1394 aa  191  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  27.63 
 
 		 1330 aa  185  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3104  ATP-dependent helicase HrpA  28.57 
 
 		 1388 aa  183  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.623202  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  26.38 
 
 		 1282 aa  182  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  25.57 
 
 		 1560 aa  181  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2226  ATP-dependent helicase HrpA  29.64 
 
 		 1351 aa  181  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0855777 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  36.57 
 
 		 769 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  24.84 
 
 		 824 aa  176  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  28.36 
 
 		 1222 aa  171  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  29.43 
 
 		 1353 aa  170  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  43.41 
 
 		 1135 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  39.45 
 
 		 771 aa  165  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  41.29 
 
 		 1342 aa  163  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  40.93 
 
 		 924 aa  162  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44062  predicted protein  26.58 
 
 		 1943 aa  162  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284084  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  39.61 
 
 		 1189 aa  161  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  23.92 
 
 		 1270 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  29.53 
 
 		 1624 aa  158  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  38.1 
 
 		 1128 aa  157  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  34.8 
 
 		 989 aa  157  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  40.09 
 
 		 1261 aa  156  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  38.64 
 
 		 1241 aa  155  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1212  ATP-dependent helicase HrpA  39.06 
 
 		 1376 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  37.93 
 
 		 1307 aa  155  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  34.19 
 
 		 1012 aa  154  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  40.18 
 
 		 720 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>