More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54577 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  100 
 
 		 790 aa  1626    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  39.49 
 
 		 811 aa  519  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  38.71 
 
 		 1041 aa  514  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  38.37 
 
 		 936 aa  486  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  36.85 
 
 		 1325 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  36.34 
 
 		 1436 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  36.12 
 
 		 1288 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  33.74 
 
 		 1450 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  34.58 
 
 		 1407 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  35.52 
 
 		 1581 aa  339  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  37.79 
 
 		 528 aa  327  7e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  37.32 
 
 		 1294 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  32.81 
 
 		 720 aa  308  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  34.01 
 
 		 1326 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  33.96 
 
 		 1326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  33.87 
 
 		 1342 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  35.02 
 
 		 1281 aa  304  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  35.01 
 
 		 1075 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  35.25 
 
 		 1545 aa  303  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1338 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  32.06 
 
 		 1241 aa  301  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1900  ATP-dependent helicase HrpA  33.81 
 
 		 1293 aa  301  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  32.7 
 
 		 771 aa  300  7e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  32.95 
 
 		 697 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  35.06 
 
 		 1324 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1933  ATP-dependent helicase HrpA  33.49 
 
 		 1293 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  32.57 
 
 		 1189 aa  298  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 		 1355 aa  298  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2386  ATP-dependent helicase HrpA  34.69 
 
 		 1291 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.473079  normal  0.224291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1940  ATP-dependent helicase HrpA  34.69 
 
 		 1293 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.359117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1907  ATP-dependent helicase HrpA  34.69 
 
 		 1293 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  33.89 
 
 		 1308 aa  296  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  31.17 
 
 		 769 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  34.81 
 
 		 1301 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  34.81 
 
 		 1301 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  34.47 
 
 		 1301 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  33.06 
 
 		 1293 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  33.55 
 
 		 1293 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  33.39 
 
 		 1293 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  33.81 
 
 		 1135 aa  293  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  31.79 
 
 		 1374 aa  293  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  33.39 
 
 		 1293 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  32.8 
 
 		 1303 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  34.72 
 
 		 1318 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  34.23 
 
 		 1328 aa  291  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  34.36 
 
 		 1282 aa  291  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  34.67 
 
 		 1301 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  33.01 
 
 		 783 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  30.25 
 
 		 1469 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0254  ATP-dependent helicase HrpA  32.34 
 
 		 1290 aa  290  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0009  ATP-dependent helicase HrpA  33.8 
 
 		 1566 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.765475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1700  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.73 
 
 		 1298 aa  289  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0497  ATP-dependent helicase HrpA  34.27 
 
 		 1316 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.663387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  34.78 
 
 		 1312 aa  288  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  35.48 
 
 		 1312 aa  287  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  35.12 
 
 		 1303 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  33.44 
 
 		 1312 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  34.21 
 
 		 1296 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.89 
 
 		 1345 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  32.21 
 
 		 1303 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  34.39 
 
 		 1428 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0245  ATP-dependent helicase HrpA  32.84 
 
 		 1307 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.389003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  33.98 
 
 		 1478 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  33.11 
 
 		 989 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02394  helicase, ATP-dependent  32.41 
 
 		 1318 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  34.75 
 
 		 1307 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  34.32 
 
 		 1324 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.45 
 
 		 1306 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  33.5 
 
 		 1275 aa  281  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0997  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.06 
 
 		 1309 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  33.22 
 
 		 873 aa  281  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.45 
 
 		 1306 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  33.73 
 
 		 1295 aa  280  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2213  ATP-dependent helicase HrpA  33.89 
 
 		 1310 aa  280  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  279  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  32.07 
 
 		 924 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1911  ATP-dependent helicase HrpA  33.45 
 
 		 1291 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0589397  normal  0.0863094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.28 
 
 		 1306 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.28 
 
 		 1306 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2683  ATP-dependent helicase HrpA  33.84 
 
 		 1291 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0992  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.56 
 
 		 1303 aa  280  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.28 
 
 		 1300 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1619  ATP-dependent helicase HrpA  33.18 
 
 		 1289 aa  280  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.752361  normal  0.176036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  31.95 
 
 		 1281 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1783  ATP-dependent RNA helicase HrpA  33.72 
 
 		 1295 aa  279  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  34.18 
 
 		 1310 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  278  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  34.41 
 
 		 1466 aa  278  3e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  278  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.95 
 
 		 1300 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  33.72 
 
 		 1320 aa  278  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  34.03 
 
 		 1402 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.78 
 
 		 1300 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2170  ATP-dependent helicase HrpA  31.96 
 
 		 1282 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.299088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  33.78 
 
 		 1375 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.78 
 
 		 1375 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  33.28 
 
 		 1325 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  33.9 
 
 		 1339 aa  275  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>