More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88040 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  52.66 
 
 		 956 aa  684    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  43.96 
 
 		 1295 aa  736    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  100 
 
 		 1270 aa  2620    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  39.24 
 
 		 1153 aa  548  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  34.05 
 
 		 771 aa  331  7e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  31.56 
 
 		 713 aa  324  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00133  pre-mRNA splicing factor RNA helicase (Prp43), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11620)  34.63 
 
 		 769 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0995  ATP-dependent helicase HrpA  32.27 
 
 		 1438 aa  297  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000102149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1049  ATP dependent DNA/RNA helicase  29.74 
 
 		 1423 aa  293  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.302189 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  30.47 
 
 		 1041 aa  293  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  35.39 
 
 		 1326 aa  291  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1419  ATP-dependent helicase HrpA  32.73 
 
 		 1421 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.680764  normal  0.0419537 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  31.85 
 
 		 699 aa  283  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  35.57 
 
 		 1349 aa  281  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  35.35 
 
 		 1320 aa  281  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  34.18 
 
 		 1355 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  32.5 
 
 		 1462 aa  279  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  33.33 
 
 		 1378 aa  278  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  31.81 
 
 		 1331 aa  277  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  34.99 
 
 		 1435 aa  276  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  52.45 
 
 		 511 aa  276  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  32.19 
 
 		 1428 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  27.69 
 
 		 811 aa  270  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  34.05 
 
 		 1353 aa  270  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  34.71 
 
 		 1361 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 		 1403 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 		 1375 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 		 1375 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 		 1402 aa  266  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 		 1375 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 		 1375 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  33.13 
 
 		 1375 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  32.97 
 
 		 1375 aa  264  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  32.97 
 
 		 1375 aa  264  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  32.87 
 
 		 1402 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  34.99 
 
 		 1378 aa  263  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01010  ATP-dependent helicase HrpA  32.77 
 
 		 1560 aa  261  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.573164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  34.4 
 
 		 1402 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  28.21 
 
 		 1407 aa  256  3e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  31.59 
 
 		 1466 aa  255  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2723  ATP-dependent helicase HrpA  34.35 
 
 		 1289 aa  255  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  31.68 
 
 		 1478 aa  253  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2106  ATP-dependent helicase HrpA  33.03 
 
 		 1298 aa  253  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.426464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0074  ATP-dependent helicase HrpA  37.06 
 
 		 1624 aa  244  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.292944  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  30.73 
 
 		 790 aa  242  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  39.23 
 
 		 1135 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  30.66 
 
 		 1222 aa  213  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  34.07 
 
 		 1261 aa  212  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  42.8 
 
 		 679 aa  207  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51921  predicted protein  39.93 
 
 		 422 aa  207  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  43.14 
 
 		 1075 aa  206  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  45.98 
 
 		 924 aa  205  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  43.12 
 
 		 720 aa  204  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  41.28 
 
 		 1128 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  40.44 
 
 		 989 aa  202  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  41.11 
 
 		 697 aa  202  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  28.79 
 
 		 891 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  42.86 
 
 		 1241 aa  202  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  31.1 
 
 		 837 aa  197  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  37.88 
 
 		 1012 aa  197  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  34.1 
 
 		 824 aa  196  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  40.62 
 
 		 873 aa  194  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  34.29 
 
 		 1312 aa  192  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.09 
 
 		 825 aa  192  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  42.24 
 
 		 1189 aa  191  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  34.55 
 
 		 1294 aa  190  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  41.87 
 
 		 1317 aa  189  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  40.37 
 
 		 783 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  37.9 
 
 		 1297 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  42.8 
 
 		 1307 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  36.14 
 
 		 1312 aa  185  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  40.65 
 
 		 1310 aa  184  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  32.88 
 
 		 1339 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  44.39 
 
 		 1324 aa  181  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  34.26 
 
 		 1339 aa  181  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  44.29 
 
 		 1298 aa  181  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  29.44 
 
 		 853 aa  180  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.04 
 
 		 834 aa  180  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  30.04 
 
 		 829 aa  180  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  44.65 
 
 		 1312 aa  179  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  40.22 
 
 		 1318 aa  178  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31907  ATP-dependent RNA helicase DHR2 (DEAH-box RNA helicase DHR2) (Helicase JA2)  38.24 
 
 		 830 aa  178  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.953528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  36.28 
 
 		 1275 aa  177  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  42.72 
 
 		 1441 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2229  ATP-dependent helicase HrpA  45.28 
 
 		 1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  43.46 
 
 		 1303 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  31.64 
 
 		 1305 aa  177  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2138  ATP-dependent helicase HrpA  44.81 
 
 		 1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.489982  hitchhiker  0.000558366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1897  ATP-dependent helicase HrpA  44.81 
 
 		 1293 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161689 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  34.13 
 
 		 670 aa  175  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  39.42 
 
 		 1323 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  39.53 
 
 		 1324 aa  174  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1746  ATP-dependent RNA helicase HrpA  36.48 
 
 		 1295 aa  174  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  40.25 
 
 		 1316 aa  173  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  44.34 
 
 		 1293 aa  174  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  38.99 
 
 		 1310 aa  173  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20335  predicted protein  37.41 
 
 		 665 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  40.94 
 
 		 1326 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  36.68 
 
 		 1291 aa  173  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0228  ATP-dependent helicase HrpA  43.72 
 
 		 1471 aa  173  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.406446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>