More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06585 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06585  DEAH-box RNA helicase (Dhr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04330)  100 
 
 
956 aa  1955    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.61345  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88040  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA) ExtraCellular Mutant DEAH-box protein involved in ribosome synthesis  51.59 
 
 
1270 aa  668    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0404872  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  48.29 
 
 
1295 aa  616  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38526  predicted protein  46.31 
 
 
1153 aa  515  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  36.85 
 
 
1297 aa  296  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  35.05 
 
 
1331 aa  294  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  34.49 
 
 
790 aa  263  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_708  predicted protein  49.64 
 
 
511 aa  261  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0736  helicase, ATP dependent  33.74 
 
 
1478 aa  251  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.336405  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  33.86 
 
 
1361 aa  246  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  29.36 
 
 
833 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  30.44 
 
 
1581 aa  204  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02390  pre-mRNA splicing factor, putative  42.8 
 
 
1075 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  49.52 
 
 
1307 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04032  mRNA splicing factor RNA helicase (Prp16), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03820)  44.18 
 
 
924 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000257481  normal  0.194201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1858  ATP-dependent helicase HrpB  29.36 
 
 
891 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  41.86 
 
 
989 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13420  ATP-dependent helicase HrpA  49.76 
 
 
1298 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31151  predicted protein  46.23 
 
 
1135 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.219431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4550  ATP-dependent helicase HrpA  48.33 
 
 
1391 aa  198  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331975 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12120  predicted protein  43.02 
 
 
697 aa  197  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1388  ATP-dependent helicase HrpA  49.04 
 
 
1312 aa  197  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1063  ATP-dependent helicase HrpA  46.61 
 
 
1317 aa  197  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  31.8 
 
 
1288 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4670  ATP-dependent helicase HrpA  50 
 
 
1333 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157839  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04721  hypothetical protein similar to ATP dependent helicase (Broad)  42.15 
 
 
1241 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02430  pre-mRNA splicing factor, putative  41.67 
 
 
1261 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.424858  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43956  predicted protein  41.83 
 
 
679 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.550471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1291  ATP-dependent helicase HrpA  47.64 
 
 
1441 aa  195  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.723467  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  47.37 
 
 
1341 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19937  predicted protein  43.96 
 
 
1012 aa  194  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  47.37 
 
 
1341 aa  194  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05827  mRNA splicing factor RNA helicase (Cdc28), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07710)  41.6 
 
 
1128 aa  194  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06085  ATP-dependent RNA helicase (Hrh1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09230)  42.62 
 
 
824 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44535  normal  0.257156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1482  ATP-dependent helicase HrpA  47.6 
 
 
1294 aa  193  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1709  ATP-dependent helicase HrpA  47.89 
 
 
1339 aa  193  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  48.08 
 
 
1310 aa  194  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  45.37 
 
 
1329 aa  193  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1251  ATP-dependent RNA helicase protein  43.95 
 
 
1331 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.301256  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1171  ATP-dependent helicase HrpA  43.95 
 
 
1310 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1079  ATP-dependent helicase HrpA  43.95 
 
 
1333 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.880342  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1821  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.05 
 
 
1306 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1698  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.22 
 
 
1306 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.615295  decreased coverage  0.00323043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1515  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.22 
 
 
1306 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1761  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.22 
 
 
1306 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.172318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1758  ATP-dependent RNA helicase HrpA  47.22 
 
 
1300 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.199323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  29.73 
 
 
854 aa  191  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  44.84 
 
 
1338 aa  191  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  44.83 
 
 
1316 aa  190  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1712  ATP-dependent helicase HrpA  46.48 
 
 
1339 aa  190  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  40.08 
 
 
873 aa  190  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2225  ATP-dependent helicase HrpA  44.34 
 
 
1324 aa  190  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.58755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01368  ATP-dependent helicase  46.3 
 
 
1281 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.957415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2232  ATP-dependent helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95685  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2016  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0120087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2317  ATP-dependent helicase HrpA  47.71 
 
 
1324 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.704668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2245  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.448406  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1633  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1594  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1759  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1496  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.3 
 
 
1300 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1627  ATP-dependent helicase HrpA  47.09 
 
 
1341 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1462 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  44.83 
 
 
1380 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23865  predicted protein  41.7 
 
 
720 aa  188  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1428 aa  188  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  43.7 
 
 
1312 aa  188  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  44.23 
 
 
1329 aa  187  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  46.15 
 
 
1375 aa  187  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  46.15 
 
 
1375 aa  187  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2288  ATP-dependent RNA helicase HrpA  46.51 
 
 
1295 aa  187  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.155291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  44.4 
 
 
1296 aa  187  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  43.5 
 
 
1323 aa  187  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1275 aa  187  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2667  ATP-dependent helicase HrpA  46.95 
 
 
1303 aa  187  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597401  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00900  pre-mRNA splicing factor, putative  43.96 
 
 
1189 aa  187  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  46.63 
 
 
1281 aa  187  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  46.95 
 
 
1306 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1320 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  45.93 
 
 
1353 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  30.04 
 
 
821 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  39.69 
 
 
783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1326 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  45.45 
 
 
1374 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2074  ATP-dependent helicase HrpA  47.89 
 
 
1318 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.717969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  45.67 
 
 
1326 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  42.31 
 
 
1282 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1592  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1312 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  44.02 
 
 
1303 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1375 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  44.02 
 
 
1303 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  46.48 
 
 
1355 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1375 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1375 aa  186  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1839  ATP-dependent helicase HrpA  46.92 
 
 
1293 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0262766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  43.53 
 
 
1222 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1375 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  45.67 
 
 
1375 aa  185  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  43.53 
 
 
1378 aa  186  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1109  ATP-dependent helicase HrpA  43.05 
 
 
1296 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>