More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3295 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 434 aa  872    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  41.22 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  41.22 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  41.22 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  41.47 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  43.02 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  39.27 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  37.36 
 
 		 587 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.25 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  31.91 
 
 		 685 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  31.86 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  31.01 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.32 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  41.48 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  31.14 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  40.64 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  29.12 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30.77 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  28.37 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 588 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.75 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  25.68 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  28.21 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  28.78 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  28.54 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.47 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  29.79 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  29.15 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  27 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  27.17 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  31.58 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  35.75 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  37.71 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  26.84 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  37.64 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  28.47 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.09 
 
 		 341 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 		 337 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.75 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  27.97 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  28.16 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  28.16 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  37.36 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.11 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  26.69 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  25.61 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  26.57 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  30.59 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  25.66 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 282 aa  100  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  27.15 
 
 		 322 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 362 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  26.87 
 
 		 339 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  28.46 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 335 aa  99.8  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  36.76 
 
 		 406 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.25 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  37.84 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  26.91 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  36.46 
 
 		 328 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  27.64 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  25.78 
 
 		 333 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  24.93 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  24.54 
 
 		 335 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>