More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12574 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  851    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  64.41 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  64.41 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  64.41 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  63.16 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  66.39 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  59.7 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  41.55 
 
 		 418 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  39.27 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  38.16 
 
 		 493 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  36.24 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  48.26 
 
 		 587 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  36.97 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.09 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  32.1 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  33.6 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  33.42 
 
 		 685 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  31.09 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  32.83 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  30.52 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  39.66 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.68 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  31.52 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  28.46 
 
 		 588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  27.6 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  25.98 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 335 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  27.02 
 
 		 351 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  28.17 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  24.31 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  25.45 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.98 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  26.84 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  32.66 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  27.48 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  28.5 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  25.08 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  27.8 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  23.36 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  29.79 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  28.7 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  24.14 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  25.34 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 363 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 623 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  24.05 
 
 		 600 aa  96.3  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  25.79 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  25.42 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  30.69 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  36.89 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  23.1 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  24.25 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  27.16 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  26.18 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  22.87 
 
 		 355 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  23.98 
 
 		 658 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  27.95 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  31.46 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 335 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  25.59 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  23.77 
 
 		 546 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  31.46 
 
 		 362 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  90.5  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  25.53 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.52 
 
 		 317 aa  89.7  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  26.1 
 
 		 691 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  22.75 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 336 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  22.57 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  40.59 
 
 		 316 aa  86.7  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  21.9 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  23.04 
 
 		 341 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  22.83 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  26.52 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  22.55 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>