More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1696 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 468 aa  921    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  61.42 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  41.99 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  38.37 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  41.94 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  45.99 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  41.44 
 
 		 372 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  41.33 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  37.64 
 
 		 407 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  37.86 
 
 		 685 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 401 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.09 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  36.59 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  39.91 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  34.24 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 376 aa  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 		 393 aa  146  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  30.17 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 588 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 		 335 aa  136  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.91 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 587 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  32.18 
 
 		 396 aa  126  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 623 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  27.56 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  31.81 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 352 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.4 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 337 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 344 aa  120  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  26.98 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 345 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  26.75 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.42 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.36 
 
 		 340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.86 
 
 		 363 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  36.05 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 691 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  26.79 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.27 
 
 		 356 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  31.63 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30.97 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  27.43 
 
 		 341 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 344 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  28.45 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.54 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.62 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 338 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 339 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30.82 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 339 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 341 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 620 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  30.72 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  27.9 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  27.58 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  27.25 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 349 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  25.76 
 
 		 658 aa  100  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 332 aa  99.8  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  30.25 
 
 		 338 aa  99.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  31.37 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  24.78 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  27.53 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>