More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2068 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  100 
 
 		 685 aa  1368    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  51.69 
 
 		 456 aa  333  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  48.61 
 
 		 385 aa  287  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  47.52 
 
 		 387 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  45.54 
 
 		 456 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  44.41 
 
 		 342 aa  253  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  43.67 
 
 		 372 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  41.75 
 
 		 536 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  48.07 
 
 		 320 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43.48 
 
 		 368 aa  194  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  37.08 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 401 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  36.14 
 
 		 390 aa  177  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  37.94 
 
 		 401 aa  177  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  39.35 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 376 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  40.91 
 
 		 382 aa  173  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 		 468 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  31.34 
 
 		 396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  39.03 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 393 aa  164  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  34.69 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  34.4 
 
 		 401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 485 aa  152  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 588 aa  150  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.74 
 
 		 395 aa  150  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.4 
 
 		 363 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 415 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 415 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 415 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  28.68 
 
 		 409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 415 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  31.91 
 
 		 434 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.38 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 415 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30.59 
 
 		 422 aa  130  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 		 376 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.94 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.91 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.57 
 
 		 370 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 322 aa  127  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 		 345 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 418 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 		 355 aa  124  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 		 471 aa  124  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 464 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 357 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  29.95 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 		 351 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.27 
 
 		 338 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  26.22 
 
 		 333 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  26.96 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 369 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.6 
 
 		 493 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  25.65 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 		 369 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 442 aa  117  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 		 337 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.28 
 
 		 414 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 416 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 412 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 405 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.83 
 
 		 403 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  25.66 
 
 		 355 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.92 
 
 		 340 aa  112  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 		 362 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 349 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 399 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  31.32 
 
 		 362 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 389 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.09 
 
 		 335 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 353 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 		 425 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.3 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 		 400 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  31.79 
 
 		 335 aa  109  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 360 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 		 357 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 		 421 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.53 
 
 		 356 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 337 aa  108  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.14 
 
 		 658 aa  107  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  30.62 
 
 		 337 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  28.98 
 
 		 438 aa  107  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  26.82 
 
 		 356 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 391 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 387 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>