More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2783 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  70.45 
 
 		 467 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  70.45 
 
 		 467 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  88.38 
 
 		 454 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 456 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  70.91 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  67.74 
 
 		 471 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  58.53 
 
 		 579 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  58.49 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  57.18 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  55.52 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  54.59 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  54.52 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  54.62 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  56.51 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  54.44 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  54.11 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  48.96 
 
 		 414 aa  342  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  46.89 
 
 		 412 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  49.29 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  47.04 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  47.18 
 
 		 391 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  46.47 
 
 		 438 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  45.51 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  45.11 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  53.58 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  49.03 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  45.37 
 
 		 369 aa  299  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  48.78 
 
 		 328 aa  292  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  43.53 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  41.22 
 
 		 393 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  40.96 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  39.68 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  40.16 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  39.6 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  54.67 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  43.69 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  43.23 
 
 		 323 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 312 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  45.02 
 
 		 339 aa  227  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  40.97 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 392 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  39.53 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  40.14 
 
 		 335 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 363 aa  206  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 332 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  35.74 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 332 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.63 
 
 		 341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  35.74 
 
 		 363 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.83 
 
 		 338 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  40.28 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.68 
 
 		 358 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.88 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.9 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.67 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 		 332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.06 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  35.22 
 
 		 340 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.09 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.48 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  34.52 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  34.97 
 
 		 340 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  34.15 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  41.02 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.58 
 
 		 370 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  35.83 
 
 		 339 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  34.23 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  39.03 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  37.79 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.64 
 
 		 343 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.24 
 
 		 345 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 		 315 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 		 339 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 		 339 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  34.38 
 
 		 316 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  37.92 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 		 337 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  40.64 
 
 		 336 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.81 
 
 		 342 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>