More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3409 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 339 aa  669    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  45.4 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  43.21 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  42.86 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  40.06 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  38.83 
 
 		 403 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  43.59 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  43.93 
 
 		 456 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  40.43 
 
 		 415 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  40.49 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  40.06 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  40.57 
 
 		 416 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  39.74 
 
 		 412 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  43.2 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.37 
 
 		 414 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 405 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  38.04 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  38.75 
 
 		 422 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  39.81 
 
 		 406 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  45.26 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  39.88 
 
 		 464 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  40.44 
 
 		 579 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  37.13 
 
 		 412 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  40.75 
 
 		 599 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  41.8 
 
 		 471 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  39.53 
 
 		 369 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  41.06 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  33.78 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 392 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  35.5 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  38.62 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  38.62 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  38.62 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  38.62 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  38.62 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  44.65 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  44.65 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  36.82 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  43.81 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  36.46 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  36.1 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  44.84 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  43.3 
 
 		 341 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  41.84 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  40.59 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  32.06 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  43.75 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  43.3 
 
 		 341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  43.3 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  41.78 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  33.75 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  38.49 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  33.94 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.73 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.83 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  36.1 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.53 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  45 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  31.75 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  33.74 
 
 		 421 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.19 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  38.02 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  48.09 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  32.47 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  39.51 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  41.41 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  43.01 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  41.6 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>