More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1218 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
348 aa  693    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  54.87 
 
 
349 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  49.71 
 
 
372 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  45.56 
 
 
412 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  45.56 
 
 
405 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  46.67 
 
 
467 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  46.67 
 
 
467 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  47.15 
 
 
471 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  47.06 
 
 
403 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  46.99 
 
 
464 aa  291  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  47.34 
 
 
442 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  44.67 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  44.54 
 
 
391 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  43.35 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  46.6 
 
 
412 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  43.64 
 
 
414 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  43.29 
 
 
579 aa  278  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  42.02 
 
 
392 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  42.02 
 
 
393 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  45.8 
 
 
416 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  46.31 
 
 
415 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  45.95 
 
 
407 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  45.56 
 
 
425 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  43.49 
 
 
399 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  42.09 
 
 
384 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  45.09 
 
 
422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  43.02 
 
 
369 aa  271  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  46.22 
 
 
418 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  43.54 
 
 
456 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  45.85 
 
 
406 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  41.62 
 
 
599 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  43.58 
 
 
385 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  40.26 
 
 
384 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  49.08 
 
 
454 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  46.89 
 
 
323 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  44.18 
 
 
325 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  45.76 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  38.38 
 
 
392 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  38.28 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 
331 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.42 
 
 
338 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  36.48 
 
 
343 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 
334 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  34.87 
 
 
340 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 
339 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 
356 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  35.18 
 
 
340 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  33.83 
 
 
340 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  34.85 
 
 
340 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  33.53 
 
 
338 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  34.85 
 
 
340 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  34.85 
 
 
340 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  34.85 
 
 
340 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  40.51 
 
 
393 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 
336 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  34.52 
 
 
338 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 
339 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 
315 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  35.35 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.12 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  38.06 
 
 
357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
341 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 
427 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.31 
 
 
337 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 
341 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 
336 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  33.96 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  37.13 
 
 
363 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 
332 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.69 
 
 
343 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.58 
 
 
346 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.01 
 
 
351 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  33.14 
 
 
427 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.02 
 
 
355 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 
333 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.27 
 
 
358 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 
332 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.56 
 
 
370 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 
345 aa  176  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 
343 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  34.81 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.73 
 
 
371 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 
341 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>