More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0560 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  92.72 
 
 		 464 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  99.36 
 
 		 467 aa  930    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 467 aa  935    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  72.5 
 
 		 471 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  70.02 
 
 		 456 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  69.16 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  55.73 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  55.47 
 
 		 579 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  58.22 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  56.82 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  55.93 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  52.99 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  56.82 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  56.01 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  56.58 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  54.44 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  49.86 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  46.4 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  48.97 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  45.97 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  46.96 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  54.08 
 
 		 349 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  44.8 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  43.37 
 
 		 403 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  44 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  48.35 
 
 		 372 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  46.67 
 
 		 348 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  44.34 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  45.54 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  40.43 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  40.16 
 
 		 392 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  39.89 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  39.9 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  52.53 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  54.21 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  41.78 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  41.33 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  41.81 
 
 		 331 aa  220  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  40.72 
 
 		 339 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  36.71 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  36.72 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  36.72 
 
 		 363 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  35.31 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 357 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38.72 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  35.01 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  35.54 
 
 		 358 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  34.51 
 
 		 343 aa  193  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 		 343 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.82 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.31 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 		 387 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.16 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  39.32 
 
 		 332 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  34.78 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 332 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.17 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.53 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.81 
 
 		 393 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 339 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  34.28 
 
 		 316 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 327 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  37.78 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.23 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.06 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  32.62 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 342 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  34.04 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  31.91 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 		 336 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.23 
 
 		 343 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.23 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 345 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>