More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0419 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 328 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  51.48 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  48.75 
 
 		 442 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  46.13 
 
 		 579 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  48.92 
 
 		 456 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  45.73 
 
 		 599 aa  292  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  46.77 
 
 		 464 aa  288  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  47.52 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  45.54 
 
 		 467 aa  285  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  45.54 
 
 		 467 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 454 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  47.52 
 
 		 415 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  46.54 
 
 		 418 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  46.89 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  47.2 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  47.68 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  47.04 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  46.69 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  46.01 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  44.86 
 
 		 405 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  46.11 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  45.69 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  46.73 
 
 		 407 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  43.45 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  45.17 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  43.93 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  47.28 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  44.93 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  47 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  36.53 
 
 		 392 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  37.33 
 
 		 393 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  41.02 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  41.95 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  48.91 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  40.24 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  41.92 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  41.28 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  35.37 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  41.37 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  42.28 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  39.17 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  40.29 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  40.98 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  38.99 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  40.13 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  41.31 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  41.39 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  40.98 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.88 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 392 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  40.66 
 
 		 340 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  39.6 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  40.33 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  39.54 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  40.5 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  39.54 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 		 421 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  36.87 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  38.28 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  38.94 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  39.81 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  37.28 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.43 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  37.31 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.9 
 
 		 345 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.13 
 
 		 343 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  40.33 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.04 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  41.58 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>