More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2179 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  61.82 
 
 		 385 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  61.78 
 
 		 392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  59.06 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  59.32 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  56.1 
 
 		 384 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  54.31 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  42.09 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  40.8 
 
 		 442 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  41.94 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  40.63 
 
 		 414 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  40.37 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  39.9 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  39.9 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 579 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  40.11 
 
 		 471 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  41.21 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  40.11 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 415 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  38.5 
 
 		 599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  51.98 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  40.91 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  38.84 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  44.2 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  38.57 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  42.41 
 
 		 425 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  36.05 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  37.53 
 
 		 407 aa  236  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  52.23 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  39.77 
 
 		 325 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 		 312 aa  209  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  41.2 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  35.85 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.08 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 363 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  43.78 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.78 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.95 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.79 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  34.67 
 
 		 341 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  50.54 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  34.67 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  33.59 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  44.86 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.14 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 343 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  34.22 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  48.1 
 
 		 357 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 		 312 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  36.44 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  43.72 
 
 		 324 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  44.44 
 
 		 341 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  40.64 
 
 		 338 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  34.22 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  44.54 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  35.55 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  36.32 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  35.55 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  45.19 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  45.19 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  30.89 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  50.83 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  37.77 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 345 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  36.34 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  41.42 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.16 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.97 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  41.92 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  43.1 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  50.85 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  33.7 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>