More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0448 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 312 aa  631  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  61.25 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  61.59 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  46.81 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  43.17 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  46.26 
 
 		 442 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  45.61 
 
 		 438 aa  241  9e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  45.61 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  43.51 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  42.72 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  40.99 
 
 		 412 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  45.88 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  45.76 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  40.37 
 
 		 405 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  44.33 
 
 		 415 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  41.78 
 
 		 467 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  41.78 
 
 		 467 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  43.29 
 
 		 422 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  41.95 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  44.21 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  41.28 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  43.01 
 
 		 464 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  43.71 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  40.41 
 
 		 369 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  42.28 
 
 		 416 aa  223  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  44.03 
 
 		 579 aa  221  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  43.01 
 
 		 471 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  45.08 
 
 		 454 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  55.81 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  42.81 
 
 		 425 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  42.42 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  43.17 
 
 		 599 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  54.42 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  54.42 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  40.14 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  43.73 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  40.28 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  50.93 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  49.54 
 
 		 392 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  38.23 
 
 		 358 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.57 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.51 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  40.7 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.76 
 
 		 370 aa  175  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  36.68 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.3 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  37.82 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 393 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.17 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  37.63 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.77 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.41 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  37.98 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  39.15 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 421 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  38.43 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.68 
 
 		 349 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.97 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 406 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  37.6 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  39.92 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  33.67 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  35.55 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  37.98 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.79 
 
 		 379 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  33.79 
 
 		 371 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  35.66 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>