More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2303 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  85.14 
 
 		 407 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  80.68 
 
 		 415 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 422 aa  846    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  82.08 
 
 		 425 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  82.37 
 
 		 416 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  82.61 
 
 		 406 aa  599  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  80.05 
 
 		 418 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  53.12 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  53.12 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  53.07 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  52.63 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  55.46 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  54.76 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  51.33 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  52.25 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  49.33 
 
 		 579 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  45.66 
 
 		 412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  46.8 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  48.02 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  46.42 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  48.73 
 
 		 414 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  45.66 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  45.43 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  50.99 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  45.15 
 
 		 412 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  42.3 
 
 		 369 aa  296  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 		 372 aa  282  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  46.11 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  45.09 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  38.65 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  38.38 
 
 		 392 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  36.32 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  36.07 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  43.15 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  43.29 
 
 		 312 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  49.3 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  39.73 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  37.16 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.17 
 
 		 363 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 335 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.88 
 
 		 358 aa  196  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 343 aa  196  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.14 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.24 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  34.04 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  32.49 
 
 		 355 aa  186  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  35.26 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  34.24 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 		 334 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  35.44 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 		 336 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  35.26 
 
 		 349 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  32.65 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  35.49 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  34.88 
 
 		 340 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 339 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 339 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 332 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0876  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 353 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  38.97 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  31.78 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  35.11 
 
 		 324 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  32.04 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 357 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  31.25 
 
 		 371 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  35.44 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>