More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1532 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  849    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  71.18 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  72.59 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  71.35 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  63.01 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  60.05 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  59.14 
 
 		 412 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  62.99 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  52.23 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  48.97 
 
 		 467 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  48.97 
 
 		 467 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  49.44 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  52.96 
 
 		 599 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  48.73 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  51.31 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  50.59 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  48.38 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  49.87 
 
 		 464 aa  336  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  46.32 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  49.72 
 
 		 456 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  49.15 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  48.59 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  48.31 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  49.01 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  46.17 
 
 		 442 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  47.47 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  51.16 
 
 		 349 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  43.79 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  45.02 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  40.16 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  39.9 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  40.63 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  43.17 
 
 		 312 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  38.3 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  45.61 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  38.83 
 
 		 385 aa  232  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  41.88 
 
 		 323 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 339 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  37.8 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.48 
 
 		 345 aa  209  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 333 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.61 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  38.27 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  42.47 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  37.03 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 341 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 		 329 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 387 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.34 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  36.66 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.76 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  36.34 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  43.31 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.01 
 
 		 343 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  36.5 
 
 		 371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 345 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  40.97 
 
 		 338 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.24 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.69 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  35.49 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.59 
 
 		 355 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  41.05 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  35.61 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 335 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  34.82 
 
 		 335 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  40.44 
 
 		 320 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  35.38 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  36.21 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  34.94 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  36.21 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  36.21 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 334 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  36.21 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  36.88 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.42 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  38.59 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>