More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1341 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 325 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  56.91 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  61.59 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  45.19 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  44.55 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  44.51 
 
 		 414 aa  248  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  41.38 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  43.19 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  40.75 
 
 		 412 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  41.19 
 
 		 392 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  41.09 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  41.94 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  42.63 
 
 		 579 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  40.06 
 
 		 407 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  41.27 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  40.92 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  40.92 
 
 		 392 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  43.79 
 
 		 456 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  46.59 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  37.14 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  40.06 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  40.37 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  39.76 
 
 		 418 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  38.32 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  39.52 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  37.67 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  39.63 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  41.69 
 
 		 403 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  39.69 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  42.23 
 
 		 438 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  39.45 
 
 		 599 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  41.75 
 
 		 412 aa  225  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  42.57 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  41.58 
 
 		 399 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  39.23 
 
 		 392 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  39.24 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  41.06 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  35.74 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  35.63 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  36.49 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  32.05 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  35.95 
 
 		 350 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.93 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  36.04 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  36.54 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  32.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  38.22 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  34.24 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  31.93 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  32.64 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  35.42 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 351 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 355 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  45.98 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  35.45 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  30.91 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  37.84 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  37.94 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  32.13 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  37.55 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>