More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2905 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 337 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  64.31 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  62.24 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  62.92 
 
 		 337 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  61.42 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  57.83 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  55.78 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.74 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.7 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.56 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.85 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.48 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.4 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  38.15 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  39.73 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  37.55 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  32.43 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  42.42 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.92 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  37.07 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.59 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.5 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  33.87 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  40.6 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 442 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  36.82 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  32.36 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  32.98 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  40.08 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  37.71 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 		 412 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  38.14 
 
 		 579 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  38.16 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  36.88 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 620 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  40.87 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 464 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.51 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  36.72 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  35.89 
 
 		 599 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  39.06 
 
 		 349 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  36.88 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  32.45 
 
 		 422 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  37.66 
 
 		 389 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 467 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 425 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 467 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  39.91 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  36.61 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  36.19 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  33.88 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.11 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  35.82 
 
 		 331 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 341 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.91 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.23 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  39.66 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>