More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0557 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
326 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  45.12 
 
 
357 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.62 
 
 
356 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  40.25 
 
 
340 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.56 
 
 
344 aa  208  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 
331 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 
358 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 
333 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 
352 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  37.03 
 
 
335 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 
336 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  39.27 
 
 
579 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
327 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  39.7 
 
 
405 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 
333 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 
332 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 
345 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  37.02 
 
 
314 aa  192  7e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
599 aa  192  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  36.89 
 
 
351 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  38.69 
 
 
414 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 
344 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 
376 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.66 
 
 
377 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.99 
 
 
351 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
329 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 
412 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  42.42 
 
 
338 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 
362 aa  185  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  38.77 
 
 
620 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  40.8 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  40.8 
 
 
343 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  35.87 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.96 
 
 
340 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  40.47 
 
 
343 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 
337 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 
456 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  35.62 
 
 
345 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.55 
 
 
355 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 
339 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 
440 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  34.98 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  35.65 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.46 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  38.26 
 
 
438 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 
372 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 
332 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  36.82 
 
 
403 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  38.74 
 
 
349 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  39.86 
 
 
454 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.04 
 
 
346 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  37.92 
 
 
412 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  34.94 
 
 
340 aa  168  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 
328 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.33 
 
 
355 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 
325 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  36.23 
 
 
464 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 
416 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  38.21 
 
 
331 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  34.82 
 
 
407 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
339 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  36.66 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  32.71 
 
 
349 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
467 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
467 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  32.28 
 
 
356 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  32.4 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.83 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 
345 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 
355 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  37.59 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  34.8 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  33.55 
 
 
358 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.55 
 
 
356 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.07 
 
 
341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 
341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>