More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1696 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 341 aa  708    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  54.13 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  53.47 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  45.05 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  40.31 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  39.82 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  40.85 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  38.64 
 
 		 352 aa  231  9e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  32.84 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.72 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  30.57 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 337 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 407 aa  136  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  31.9 
 
 		 416 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.52 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  30.98 
 
 		 599 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.43 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.68 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.47 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  28.92 
 
 		 456 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 425 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  30.99 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  30.75 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  33.1 
 
 		 620 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 415 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  42.62 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  29.67 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.11 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  29.08 
 
 		 579 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.13 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.39 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  38.14 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  42.01 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  32.62 
 
 		 377 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  30.63 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.09 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 358 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.1 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  31.64 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  40.93 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 418 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  30.11 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.35 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  31.64 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 440 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 332 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  36.87 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  27.38 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  44.14 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  29.19 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  35.61 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  37.71 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>