More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5921 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 352 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  45.57 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  44.58 
 
 		 348 aa  292  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  43.5 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  40.12 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  41.3 
 
 		 345 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  38.17 
 
 		 364 aa  258  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  39.65 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.44 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  36.02 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  33.43 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.62 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.78 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  33.9 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.63 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  31.86 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  31.52 
 
 		 599 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.76 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 351 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 620 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.86 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.31 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  27.86 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  30.36 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  31.18 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.1 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.63 
 
 		 415 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.08 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 407 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 333 aa  136  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.09 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  30.09 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  27.94 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  28.15 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.76 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 326 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  28.01 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  30.67 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  27.52 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  27.91 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  27.15 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  29.12 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  27.96 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  45.39 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  28.33 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>