More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2268 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 347 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  40.33 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  39.65 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  34.93 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  42.37 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  42.01 
 
 		 336 aa  216  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  41.23 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  35.4 
 
 		 352 aa  206  6e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  34.81 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  36.64 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  38.32 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  34.04 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  35.99 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35.54 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  36.89 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.93 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.83 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  34.4 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.77 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.11 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  34.36 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  30.54 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  36.3 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.68 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  35.55 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.44 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  31.87 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  35.06 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 		 471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  35.59 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 		 599 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  34.75 
 
 		 579 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  36.42 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  34.23 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  34.73 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  31.98 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  34.8 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  35.31 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  34.8 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 339 aa  143  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>