More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1472 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 424 aa  868    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  47.69 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  40.98 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  40.39 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.28 
 
 		 355 aa  199  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 352 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  38.08 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  39.67 
 
 		 335 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  34.29 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.55 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  34.37 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 376 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  32.77 
 
 		 356 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.65 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.83 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.65 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.77 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.32 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  31.83 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.83 
 
 		 351 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.38 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.29 
 
 		 333 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  34.85 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  31.83 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  35.05 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  33.23 
 
 		 343 aa  143  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  30.49 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  31.17 
 
 		 349 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 314 aa  140  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.17 
 
 		 356 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 464 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  29.33 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 334 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 336 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 349 aa  136  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.45 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  31.12 
 
 		 600 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  31.79 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 337 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  29.93 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 351 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  25.43 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  28.88 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  25.43 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.23 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  30.85 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  29.28 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  30.46 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  28.96 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.21 
 
 		 623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  31.39 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.12 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  29.06 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  26.82 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 658 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  27.51 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>